Protein–RNA interactions for Protein: Q969Q1

TRIM63, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM63, humanhuman

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Length 353 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM63Q969Q1 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRIM63Q969Q1 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
TRIM63Q969Q1 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
TRIM63Q969Q1 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
TRIM63Q969Q1 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
TRIM63Q969Q1 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRIM63Q969Q1 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRIM63Q969Q1 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRIM63Q969Q1 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRIM63Q969Q1 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRIM63Q969Q1 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRIM63Q969Q1 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
TRIM63Q969Q1 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRIM63Q969Q1 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRIM63Q969Q1 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRIM63Q969Q1 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRIM63Q969Q1 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRIM63Q969Q1 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRIM63Q969Q1 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRIM63Q969Q1 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRIM63Q969Q1 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRIM63Q969Q1 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRIM63Q969Q1 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRIM63Q969Q1 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRIM63Q969Q1 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRIM63Q969Q1 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRIM63Q969Q1 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRIM63Q969Q1 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRIM63Q969Q1 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRIM63Q969Q1 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRIM63Q969Q1 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRIM63Q969Q1 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
TRIM63Q969Q1 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRIM63Q969Q1 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRIM63Q969Q1 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRIM63Q969Q1 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRIM63Q969Q1 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRIM63Q969Q1 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRIM63Q969Q1 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRIM63Q969Q1 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRIM63Q969Q1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRIM63Q969Q1 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRIM63Q969Q1 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRIM63Q969Q1 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRIM63Q969Q1 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRIM63Q969Q1 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRIM63Q969Q1 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRIM63Q969Q1 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRIM63Q969Q1 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRIM63Q969Q1 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRIM63Q969Q1 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRIM63Q969Q1 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRIM63Q969Q1 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRIM63Q969Q1 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRIM63Q969Q1 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRIM63Q969Q1 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRIM63Q969Q1 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRIM63Q969Q1 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRIM63Q969Q1 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRIM63Q969Q1 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRIM63Q969Q1 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRIM63Q969Q1 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRIM63Q969Q1 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRIM63Q969Q1 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TRIM63Q969Q1 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
TRIM63Q969Q1 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TRIM63Q969Q1 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TRIM63Q969Q1 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRIM63Q969Q1 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRIM63Q969Q1 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRIM63Q969Q1 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIM63Q969Q1 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIM63Q969Q1 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIM63Q969Q1 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIM63Q969Q1 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIM63Q969Q1 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIM63Q969Q1 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIM63Q969Q1 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIM63Q969Q1 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIM63Q969Q1 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIM63Q969Q1 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIM63Q969Q1 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIM63Q969Q1 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIM63Q969Q1 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIM63Q969Q1 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIM63Q969Q1 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIM63Q969Q1 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIM63Q969Q1 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIM63Q969Q1 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIM63Q969Q1 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIM63Q969Q1 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIM63Q969Q1 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIM63Q969Q1 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIM63Q969Q1 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIM63Q969Q1 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIM63Q969Q1 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIM63Q969Q1 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRIM63Q969Q1 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRIM63Q969Q1 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRIM63Q969Q1 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
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