Protein–RNA interactions for Protein: Q93088

BHMT, Betaine--homocysteine S-methyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMTQ93088 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BHMTQ93088 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BHMTQ93088 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BHMTQ93088 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BHMTQ93088 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BHMTQ93088 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
BHMTQ93088 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BHMTQ93088 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
BHMTQ93088 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BHMTQ93088 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BHMTQ93088 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BHMTQ93088 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BHMTQ93088 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BHMTQ93088 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BHMTQ93088 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BHMTQ93088 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
BHMTQ93088 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BHMTQ93088 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BHMTQ93088 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BHMTQ93088 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BHMTQ93088 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BHMTQ93088 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BHMTQ93088 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BHMTQ93088 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BHMTQ93088 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BHMTQ93088 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BHMTQ93088 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BHMTQ93088 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BHMTQ93088 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BHMTQ93088 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BHMTQ93088 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BHMTQ93088 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
BHMTQ93088 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BHMTQ93088 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BHMTQ93088 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
BHMTQ93088 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BHMTQ93088 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BHMTQ93088 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BHMTQ93088 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
BHMTQ93088 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BHMTQ93088 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BHMTQ93088 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BHMTQ93088 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BHMTQ93088 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BHMTQ93088 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BHMTQ93088 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BHMTQ93088 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BHMTQ93088 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
BHMTQ93088 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BHMTQ93088 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BHMTQ93088 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BHMTQ93088 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
BHMTQ93088 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
BHMTQ93088 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
BHMTQ93088 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
BHMTQ93088 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
BHMTQ93088 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BHMTQ93088 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BHMTQ93088 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BHMTQ93088 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BHMTQ93088 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BHMTQ93088 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BHMTQ93088 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BHMTQ93088 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BHMTQ93088 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BHMTQ93088 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BHMTQ93088 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BHMTQ93088 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BHMTQ93088 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BHMTQ93088 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BHMTQ93088 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BHMTQ93088 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BHMTQ93088 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BHMTQ93088 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BHMTQ93088 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BHMTQ93088 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BHMTQ93088 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BHMTQ93088 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BHMTQ93088 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
BHMTQ93088 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
BHMTQ93088 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
BHMTQ93088 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
BHMTQ93088 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BHMTQ93088 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
BHMTQ93088 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BHMTQ93088 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BHMTQ93088 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BHMTQ93088 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BHMTQ93088 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BHMTQ93088 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BHMTQ93088 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BHMTQ93088 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BHMTQ93088 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BHMTQ93088 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BHMTQ93088 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BHMTQ93088 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BHMTQ93088 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BHMTQ93088 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BHMTQ93088 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BHMTQ93088 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms