Protein–RNA interactions for Protein: Q92973

TNPO1, Transportin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNPO1Q92973 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TNPO1Q92973 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TNPO1Q92973 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TNPO1Q92973 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TNPO1Q92973 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TNPO1Q92973 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TNPO1Q92973 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TNPO1Q92973 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TNPO1Q92973 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TNPO1Q92973 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TNPO1Q92973 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TNPO1Q92973 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TNPO1Q92973 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TNPO1Q92973 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TNPO1Q92973 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
TNPO1Q92973 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TNPO1Q92973 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TNPO1Q92973 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TNPO1Q92973 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TNPO1Q92973 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
TNPO1Q92973 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TNPO1Q92973 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TNPO1Q92973 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TNPO1Q92973 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TNPO1Q92973 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TNPO1Q92973 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TNPO1Q92973 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TNPO1Q92973 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
TNPO1Q92973 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TNPO1Q92973 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TNPO1Q92973 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TNPO1Q92973 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TNPO1Q92973 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TNPO1Q92973 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TNPO1Q92973 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TNPO1Q92973 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TNPO1Q92973 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TNPO1Q92973 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TNPO1Q92973 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TNPO1Q92973 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TNPO1Q92973 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TNPO1Q92973 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TNPO1Q92973 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TNPO1Q92973 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TNPO1Q92973 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TNPO1Q92973 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TNPO1Q92973 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TNPO1Q92973 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TNPO1Q92973 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TNPO1Q92973 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TNPO1Q92973 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TNPO1Q92973 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TNPO1Q92973 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TNPO1Q92973 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TNPO1Q92973 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TNPO1Q92973 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TNPO1Q92973 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TNPO1Q92973 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TNPO1Q92973 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TNPO1Q92973 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TNPO1Q92973 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TNPO1Q92973 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TNPO1Q92973 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TNPO1Q92973 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TNPO1Q92973 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TNPO1Q92973 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TNPO1Q92973 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TNPO1Q92973 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TNPO1Q92973 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TNPO1Q92973 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TNPO1Q92973 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TNPO1Q92973 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TNPO1Q92973 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TNPO1Q92973 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
TNPO1Q92973 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TNPO1Q92973 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TNPO1Q92973 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TNPO1Q92973 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TNPO1Q92973 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TNPO1Q92973 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TNPO1Q92973 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TNPO1Q92973 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TNPO1Q92973 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TNPO1Q92973 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TNPO1Q92973 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TNPO1Q92973 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TNPO1Q92973 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TNPO1Q92973 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
TNPO1Q92973 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TNPO1Q92973 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TNPO1Q92973 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TNPO1Q92973 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TNPO1Q92973 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TNPO1Q92973 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TNPO1Q92973 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TNPO1Q92973 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
TNPO1Q92973 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
TNPO1Q92973 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
TNPO1Q92973 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
TNPO1Q92973 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms