Protein–RNA interactions for Protein: Q92854

SEMA4D, Semaphorin-4D, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4DQ92854 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SEMA4DQ92854 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SEMA4DQ92854 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SEMA4DQ92854 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SEMA4DQ92854 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SEMA4DQ92854 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SEMA4DQ92854 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SEMA4DQ92854 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SEMA4DQ92854 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SEMA4DQ92854 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SEMA4DQ92854 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SEMA4DQ92854 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SEMA4DQ92854 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SEMA4DQ92854 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SEMA4DQ92854 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SEMA4DQ92854 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SEMA4DQ92854 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SEMA4DQ92854 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SEMA4DQ92854 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SEMA4DQ92854 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SEMA4DQ92854 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SEMA4DQ92854 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SEMA4DQ92854 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SEMA4DQ92854 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SEMA4DQ92854 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SEMA4DQ92854 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SEMA4DQ92854 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SEMA4DQ92854 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SEMA4DQ92854 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SEMA4DQ92854 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SEMA4DQ92854 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SEMA4DQ92854 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SEMA4DQ92854 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SEMA4DQ92854 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SEMA4DQ92854 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SEMA4DQ92854 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SEMA4DQ92854 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SEMA4DQ92854 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SEMA4DQ92854 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SEMA4DQ92854 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SEMA4DQ92854 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SEMA4DQ92854 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SEMA4DQ92854 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SEMA4DQ92854 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SEMA4DQ92854 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SEMA4DQ92854 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SEMA4DQ92854 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SEMA4DQ92854 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SEMA4DQ92854 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SEMA4DQ92854 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SEMA4DQ92854 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SEMA4DQ92854 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SEMA4DQ92854 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SEMA4DQ92854 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SEMA4DQ92854 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SEMA4DQ92854 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SEMA4DQ92854 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SEMA4DQ92854 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SEMA4DQ92854 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SEMA4DQ92854 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SEMA4DQ92854 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SEMA4DQ92854 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SEMA4DQ92854 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SEMA4DQ92854 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SEMA4DQ92854 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SEMA4DQ92854 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SEMA4DQ92854 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SEMA4DQ92854 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SEMA4DQ92854 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SEMA4DQ92854 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SEMA4DQ92854 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SEMA4DQ92854 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SEMA4DQ92854 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SEMA4DQ92854 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SEMA4DQ92854 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SEMA4DQ92854 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SEMA4DQ92854 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SEMA4DQ92854 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SEMA4DQ92854 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SEMA4DQ92854 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SEMA4DQ92854 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SEMA4DQ92854 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SEMA4DQ92854 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SEMA4DQ92854 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SEMA4DQ92854 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SEMA4DQ92854 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SEMA4DQ92854 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SEMA4DQ92854 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SEMA4DQ92854 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SEMA4DQ92854 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SEMA4DQ92854 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SEMA4DQ92854 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SEMA4DQ92854 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SEMA4DQ92854 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SEMA4DQ92854 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SEMA4DQ92854 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SEMA4DQ92854 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SEMA4DQ92854 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SEMA4DQ92854 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SEMA4DQ92854 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms