Protein–RNA interactions for Protein: Q92838

EDA, Ectodysplasin-A, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDAQ92838 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EDAQ92838 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
EDAQ92838 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EDAQ92838 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EDAQ92838 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EDAQ92838 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EDAQ92838 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EDAQ92838 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EDAQ92838 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EDAQ92838 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EDAQ92838 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EDAQ92838 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EDAQ92838 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EDAQ92838 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EDAQ92838 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EDAQ92838 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EDAQ92838 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EDAQ92838 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EDAQ92838 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EDAQ92838 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EDAQ92838 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EDAQ92838 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
EDAQ92838 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EDAQ92838 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EDAQ92838 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
EDAQ92838 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EDAQ92838 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EDAQ92838 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EDAQ92838 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
EDAQ92838 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EDAQ92838 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EDAQ92838 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EDAQ92838 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EDAQ92838 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EDAQ92838 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
EDAQ92838 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EDAQ92838 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EDAQ92838 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EDAQ92838 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EDAQ92838 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EDAQ92838 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EDAQ92838 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EDAQ92838 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EDAQ92838 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EDAQ92838 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EDAQ92838 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EDAQ92838 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EDAQ92838 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EDAQ92838 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EDAQ92838 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EDAQ92838 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EDAQ92838 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EDAQ92838 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EDAQ92838 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
EDAQ92838 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EDAQ92838 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
EDAQ92838 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EDAQ92838 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EDAQ92838 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EDAQ92838 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EDAQ92838 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EDAQ92838 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EDAQ92838 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EDAQ92838 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EDAQ92838 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EDAQ92838 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
EDAQ92838 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
EDAQ92838 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
EDAQ92838 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
EDAQ92838 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EDAQ92838 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EDAQ92838 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EDAQ92838 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EDAQ92838 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
EDAQ92838 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EDAQ92838 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
EDAQ92838 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EDAQ92838 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EDAQ92838 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EDAQ92838 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
EDAQ92838 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EDAQ92838 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EDAQ92838 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EDAQ92838 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EDAQ92838 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EDAQ92838 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EDAQ92838 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EDAQ92838 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
EDAQ92838 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EDAQ92838 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EDAQ92838 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
EDAQ92838 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EDAQ92838 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EDAQ92838 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EDAQ92838 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EDAQ92838 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EDAQ92838 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EDAQ92838 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EDAQ92838 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EDAQ92838 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66 ms