Protein–RNA interactions for Protein: Q92772

CDKL2, Cyclin-dependent kinase-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL2Q92772 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CDKL2Q92772 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDKL2Q92772 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDKL2Q92772 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDKL2Q92772 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDKL2Q92772 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CDKL2Q92772 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDKL2Q92772 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDKL2Q92772 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDKL2Q92772 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDKL2Q92772 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDKL2Q92772 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDKL2Q92772 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDKL2Q92772 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDKL2Q92772 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CDKL2Q92772 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CDKL2Q92772 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDKL2Q92772 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDKL2Q92772 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDKL2Q92772 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDKL2Q92772 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDKL2Q92772 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDKL2Q92772 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDKL2Q92772 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDKL2Q92772 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDKL2Q92772 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDKL2Q92772 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDKL2Q92772 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDKL2Q92772 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDKL2Q92772 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CDKL2Q92772 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDKL2Q92772 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDKL2Q92772 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDKL2Q92772 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDKL2Q92772 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDKL2Q92772 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDKL2Q92772 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDKL2Q92772 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDKL2Q92772 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDKL2Q92772 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDKL2Q92772 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDKL2Q92772 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDKL2Q92772 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDKL2Q92772 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDKL2Q92772 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDKL2Q92772 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDKL2Q92772 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDKL2Q92772 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDKL2Q92772 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDKL2Q92772 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDKL2Q92772 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CDKL2Q92772 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CDKL2Q92772 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDKL2Q92772 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDKL2Q92772 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDKL2Q92772 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDKL2Q92772 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDKL2Q92772 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDKL2Q92772 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDKL2Q92772 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDKL2Q92772 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDKL2Q92772 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDKL2Q92772 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDKL2Q92772 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDKL2Q92772 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDKL2Q92772 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CDKL2Q92772 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CDKL2Q92772 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDKL2Q92772 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDKL2Q92772 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDKL2Q92772 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDKL2Q92772 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDKL2Q92772 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDKL2Q92772 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDKL2Q92772 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CDKL2Q92772 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CDKL2Q92772 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CDKL2Q92772 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CDKL2Q92772 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDKL2Q92772 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDKL2Q92772 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDKL2Q92772 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDKL2Q92772 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDKL2Q92772 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDKL2Q92772 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CDKL2Q92772 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDKL2Q92772 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDKL2Q92772 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDKL2Q92772 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDKL2Q92772 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDKL2Q92772 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDKL2Q92772 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDKL2Q92772 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDKL2Q92772 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDKL2Q92772 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDKL2Q92772 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDKL2Q92772 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDKL2Q92772 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDKL2Q92772 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDKL2Q92772 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 130.4 ms