Protein–RNA interactions for Protein: Q92664

GTF3A, Transcription factor IIIA, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3AQ92664 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GTF3AQ92664 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GTF3AQ92664 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GTF3AQ92664 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GTF3AQ92664 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GTF3AQ92664 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GTF3AQ92664 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GTF3AQ92664 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GTF3AQ92664 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GTF3AQ92664 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GTF3AQ92664 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GTF3AQ92664 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GTF3AQ92664 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GTF3AQ92664 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GTF3AQ92664 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GTF3AQ92664 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GTF3AQ92664 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GTF3AQ92664 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GTF3AQ92664 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GTF3AQ92664 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GTF3AQ92664 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GTF3AQ92664 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GTF3AQ92664 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GTF3AQ92664 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GTF3AQ92664 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GTF3AQ92664 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GTF3AQ92664 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GTF3AQ92664 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GTF3AQ92664 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GTF3AQ92664 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GTF3AQ92664 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GTF3AQ92664 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GTF3AQ92664 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GTF3AQ92664 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GTF3AQ92664 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GTF3AQ92664 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GTF3AQ92664 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GTF3AQ92664 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GTF3AQ92664 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GTF3AQ92664 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GTF3AQ92664 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GTF3AQ92664 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GTF3AQ92664 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GTF3AQ92664 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GTF3AQ92664 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GTF3AQ92664 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GTF3AQ92664 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
GTF3AQ92664 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GTF3AQ92664 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GTF3AQ92664 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GTF3AQ92664 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GTF3AQ92664 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GTF3AQ92664 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GTF3AQ92664 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GTF3AQ92664 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GTF3AQ92664 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GTF3AQ92664 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
GTF3AQ92664 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
GTF3AQ92664 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
GTF3AQ92664 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
GTF3AQ92664 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GTF3AQ92664 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GTF3AQ92664 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GTF3AQ92664 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GTF3AQ92664 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GTF3AQ92664 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GTF3AQ92664 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF3AQ92664 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF3AQ92664 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF3AQ92664 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF3AQ92664 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF3AQ92664 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF3AQ92664 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF3AQ92664 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF3AQ92664 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF3AQ92664 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF3AQ92664 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF3AQ92664 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF3AQ92664 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF3AQ92664 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF3AQ92664 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF3AQ92664 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GTF3AQ92664 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GTF3AQ92664 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GTF3AQ92664 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GTF3AQ92664 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GTF3AQ92664 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GTF3AQ92664 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GTF3AQ92664 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GTF3AQ92664 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GTF3AQ92664 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GTF3AQ92664 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GTF3AQ92664 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GTF3AQ92664 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GTF3AQ92664 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GTF3AQ92664 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GTF3AQ92664 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GTF3AQ92664 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
GTF3AQ92664 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GTF3AQ92664 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms