Protein–RNA interactions for Protein: Q92574

TSC1, Hamartin, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSC1Q92574 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TSC1Q92574 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TSC1Q92574 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TSC1Q92574 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TSC1Q92574 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TSC1Q92574 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TSC1Q92574 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TSC1Q92574 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TSC1Q92574 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TSC1Q92574 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TSC1Q92574 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TSC1Q92574 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TSC1Q92574 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TSC1Q92574 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TSC1Q92574 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TSC1Q92574 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TSC1Q92574 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TSC1Q92574 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TSC1Q92574 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TSC1Q92574 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TSC1Q92574 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TSC1Q92574 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TSC1Q92574 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TSC1Q92574 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TSC1Q92574 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TSC1Q92574 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TSC1Q92574 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TSC1Q92574 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TSC1Q92574 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TSC1Q92574 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TSC1Q92574 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TSC1Q92574 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TSC1Q92574 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TSC1Q92574 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TSC1Q92574 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TSC1Q92574 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TSC1Q92574 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TSC1Q92574 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TSC1Q92574 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TSC1Q92574 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TSC1Q92574 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TSC1Q92574 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TSC1Q92574 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TSC1Q92574 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TSC1Q92574 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TSC1Q92574 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TSC1Q92574 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TSC1Q92574 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TSC1Q92574 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TSC1Q92574 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TSC1Q92574 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
TSC1Q92574 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TSC1Q92574 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TSC1Q92574 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TSC1Q92574 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TSC1Q92574 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TSC1Q92574 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TSC1Q92574 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TSC1Q92574 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TSC1Q92574 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TSC1Q92574 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TSC1Q92574 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TSC1Q92574 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TSC1Q92574 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TSC1Q92574 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TSC1Q92574 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TSC1Q92574 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TSC1Q92574 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TSC1Q92574 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TSC1Q92574 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TSC1Q92574 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TSC1Q92574 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TSC1Q92574 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TSC1Q92574 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TSC1Q92574 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TSC1Q92574 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TSC1Q92574 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TSC1Q92574 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TSC1Q92574 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TSC1Q92574 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TSC1Q92574 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TSC1Q92574 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TSC1Q92574 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TSC1Q92574 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TSC1Q92574 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TSC1Q92574 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TSC1Q92574 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TSC1Q92574 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TSC1Q92574 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TSC1Q92574 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TSC1Q92574 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TSC1Q92574 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TSC1Q92574 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TSC1Q92574 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TSC1Q92574 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TSC1Q92574 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TSC1Q92574 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TSC1Q92574 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TSC1Q92574 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TSC1Q92574 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms