Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXC6

COPS9, COP9 signalosome complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS9Q8WXC6 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COPS9Q8WXC6 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COPS9Q8WXC6 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COPS9Q8WXC6 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
COPS9Q8WXC6 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
COPS9Q8WXC6 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
COPS9Q8WXC6 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
COPS9Q8WXC6 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
COPS9Q8WXC6 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COPS9Q8WXC6 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COPS9Q8WXC6 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COPS9Q8WXC6 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COPS9Q8WXC6 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COPS9Q8WXC6 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
COPS9Q8WXC6 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COPS9Q8WXC6 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COPS9Q8WXC6 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COPS9Q8WXC6 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COPS9Q8WXC6 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COPS9Q8WXC6 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COPS9Q8WXC6 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
COPS9Q8WXC6 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
COPS9Q8WXC6 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
COPS9Q8WXC6 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
COPS9Q8WXC6 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COPS9Q8WXC6 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COPS9Q8WXC6 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
COPS9Q8WXC6 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
COPS9Q8WXC6 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
COPS9Q8WXC6 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
COPS9Q8WXC6 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
COPS9Q8WXC6 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
COPS9Q8WXC6 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
COPS9Q8WXC6 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
COPS9Q8WXC6 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
COPS9Q8WXC6 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
COPS9Q8WXC6 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
COPS9Q8WXC6 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
COPS9Q8WXC6 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
COPS9Q8WXC6 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
COPS9Q8WXC6 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
COPS9Q8WXC6 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
COPS9Q8WXC6 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
COPS9Q8WXC6 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
COPS9Q8WXC6 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
COPS9Q8WXC6 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
COPS9Q8WXC6 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
COPS9Q8WXC6 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COPS9Q8WXC6 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COPS9Q8WXC6 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COPS9Q8WXC6 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COPS9Q8WXC6 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COPS9Q8WXC6 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COPS9Q8WXC6 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COPS9Q8WXC6 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COPS9Q8WXC6 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COPS9Q8WXC6 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COPS9Q8WXC6 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COPS9Q8WXC6 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COPS9Q8WXC6 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COPS9Q8WXC6 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COPS9Q8WXC6 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COPS9Q8WXC6 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COPS9Q8WXC6 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COPS9Q8WXC6 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COPS9Q8WXC6 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COPS9Q8WXC6 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COPS9Q8WXC6 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COPS9Q8WXC6 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COPS9Q8WXC6 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COPS9Q8WXC6 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COPS9Q8WXC6 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COPS9Q8WXC6 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COPS9Q8WXC6 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COPS9Q8WXC6 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COPS9Q8WXC6 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COPS9Q8WXC6 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COPS9Q8WXC6 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COPS9Q8WXC6 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
COPS9Q8WXC6 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COPS9Q8WXC6 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COPS9Q8WXC6 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COPS9Q8WXC6 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COPS9Q8WXC6 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
COPS9Q8WXC6 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COPS9Q8WXC6 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COPS9Q8WXC6 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
COPS9Q8WXC6 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COPS9Q8WXC6 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COPS9Q8WXC6 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
COPS9Q8WXC6 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
COPS9Q8WXC6 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
COPS9Q8WXC6 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
COPS9Q8WXC6 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COPS9Q8WXC6 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
COPS9Q8WXC6 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COPS9Q8WXC6 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COPS9Q8WXC6 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COPS9Q8WXC6 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COPS9Q8WXC6 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms