Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDY8

IGDCC4, Immunoglobulin superfamily DCC subclass member 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGDCC4Q8TDY8 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
IGDCC4Q8TDY8 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
IGDCC4Q8TDY8 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
IGDCC4Q8TDY8 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
IGDCC4Q8TDY8 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
IGDCC4Q8TDY8 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
IGDCC4Q8TDY8 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
IGDCC4Q8TDY8 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
IGDCC4Q8TDY8 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
IGDCC4Q8TDY8 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
IGDCC4Q8TDY8 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
IGDCC4Q8TDY8 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
IGDCC4Q8TDY8 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
IGDCC4Q8TDY8 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
IGDCC4Q8TDY8 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
IGDCC4Q8TDY8 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
IGDCC4Q8TDY8 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
IGDCC4Q8TDY8 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
IGDCC4Q8TDY8 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
IGDCC4Q8TDY8 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
IGDCC4Q8TDY8 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
IGDCC4Q8TDY8 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
IGDCC4Q8TDY8 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
IGDCC4Q8TDY8 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
IGDCC4Q8TDY8 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
IGDCC4Q8TDY8 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
IGDCC4Q8TDY8 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
IGDCC4Q8TDY8 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
IGDCC4Q8TDY8 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
IGDCC4Q8TDY8 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
IGDCC4Q8TDY8 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
IGDCC4Q8TDY8 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
IGDCC4Q8TDY8 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
IGDCC4Q8TDY8 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
IGDCC4Q8TDY8 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
IGDCC4Q8TDY8 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
IGDCC4Q8TDY8 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
IGDCC4Q8TDY8 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
IGDCC4Q8TDY8 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
IGDCC4Q8TDY8 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
IGDCC4Q8TDY8 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
IGDCC4Q8TDY8 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
IGDCC4Q8TDY8 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
IGDCC4Q8TDY8 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
IGDCC4Q8TDY8 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
IGDCC4Q8TDY8 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
IGDCC4Q8TDY8 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
IGDCC4Q8TDY8 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
IGDCC4Q8TDY8 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
IGDCC4Q8TDY8 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
IGDCC4Q8TDY8 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
IGDCC4Q8TDY8 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
IGDCC4Q8TDY8 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
IGDCC4Q8TDY8 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
IGDCC4Q8TDY8 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
IGDCC4Q8TDY8 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
IGDCC4Q8TDY8 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
IGDCC4Q8TDY8 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
IGDCC4Q8TDY8 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
IGDCC4Q8TDY8 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
IGDCC4Q8TDY8 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
IGDCC4Q8TDY8 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
IGDCC4Q8TDY8 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
IGDCC4Q8TDY8 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
IGDCC4Q8TDY8 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
IGDCC4Q8TDY8 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
IGDCC4Q8TDY8 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
IGDCC4Q8TDY8 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
IGDCC4Q8TDY8 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
IGDCC4Q8TDY8 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
IGDCC4Q8TDY8 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
IGDCC4Q8TDY8 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
IGDCC4Q8TDY8 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
IGDCC4Q8TDY8 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
IGDCC4Q8TDY8 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
IGDCC4Q8TDY8 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
IGDCC4Q8TDY8 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
IGDCC4Q8TDY8 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
IGDCC4Q8TDY8 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
IGDCC4Q8TDY8 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
IGDCC4Q8TDY8 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
IGDCC4Q8TDY8 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
IGDCC4Q8TDY8 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
IGDCC4Q8TDY8 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
IGDCC4Q8TDY8 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
IGDCC4Q8TDY8 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
IGDCC4Q8TDY8 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
IGDCC4Q8TDY8 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
IGDCC4Q8TDY8 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
IGDCC4Q8TDY8 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
IGDCC4Q8TDY8 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
IGDCC4Q8TDY8 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
IGDCC4Q8TDY8 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
IGDCC4Q8TDY8 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
IGDCC4Q8TDY8 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
IGDCC4Q8TDY8 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
IGDCC4Q8TDY8 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
IGDCC4Q8TDY8 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
IGDCC4Q8TDY8 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
IGDCC4Q8TDY8 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms