Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDG4

HELQ, Helicase POLQ-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELQQ8TDG4 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HELQQ8TDG4 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
HELQQ8TDG4 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HELQQ8TDG4 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HELQQ8TDG4 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HELQQ8TDG4 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
HELQQ8TDG4 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
HELQQ8TDG4 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
HELQQ8TDG4 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HELQQ8TDG4 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HELQQ8TDG4 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
HELQQ8TDG4 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HELQQ8TDG4 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
HELQQ8TDG4 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HELQQ8TDG4 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HELQQ8TDG4 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HELQQ8TDG4 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HELQQ8TDG4 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HELQQ8TDG4 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HELQQ8TDG4 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HELQQ8TDG4 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HELQQ8TDG4 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HELQQ8TDG4 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
HELQQ8TDG4 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HELQQ8TDG4 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HELQQ8TDG4 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HELQQ8TDG4 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HELQQ8TDG4 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HELQQ8TDG4 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HELQQ8TDG4 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HELQQ8TDG4 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HELQQ8TDG4 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HELQQ8TDG4 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HELQQ8TDG4 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HELQQ8TDG4 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HELQQ8TDG4 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HELQQ8TDG4 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HELQQ8TDG4 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HELQQ8TDG4 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HELQQ8TDG4 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HELQQ8TDG4 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HELQQ8TDG4 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HELQQ8TDG4 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HELQQ8TDG4 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HELQQ8TDG4 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HELQQ8TDG4 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HELQQ8TDG4 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HELQQ8TDG4 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HELQQ8TDG4 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HELQQ8TDG4 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HELQQ8TDG4 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HELQQ8TDG4 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HELQQ8TDG4 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HELQQ8TDG4 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HELQQ8TDG4 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HELQQ8TDG4 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HELQQ8TDG4 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HELQQ8TDG4 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HELQQ8TDG4 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HELQQ8TDG4 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HELQQ8TDG4 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
HELQQ8TDG4 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
HELQQ8TDG4 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
HELQQ8TDG4 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
HELQQ8TDG4 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
HELQQ8TDG4 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
HELQQ8TDG4 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
HELQQ8TDG4 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
HELQQ8TDG4 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
HELQQ8TDG4 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
HELQQ8TDG4 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
HELQQ8TDG4 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HELQQ8TDG4 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HELQQ8TDG4 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HELQQ8TDG4 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HELQQ8TDG4 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HELQQ8TDG4 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HELQQ8TDG4 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
HELQQ8TDG4 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
HELQQ8TDG4 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HELQQ8TDG4 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HELQQ8TDG4 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HELQQ8TDG4 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HELQQ8TDG4 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HELQQ8TDG4 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HELQQ8TDG4 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HELQQ8TDG4 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
HELQQ8TDG4 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HELQQ8TDG4 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HELQQ8TDG4 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HELQQ8TDG4 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HELQQ8TDG4 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HELQQ8TDG4 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HELQQ8TDG4 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HELQQ8TDG4 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HELQQ8TDG4 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HELQQ8TDG4 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
HELQQ8TDG4 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HELQQ8TDG4 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HELQQ8TDG4 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms