Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDF6

RASGRP4, RAS guanyl-releasing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGRP4Q8TDF6 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RASGRP4Q8TDF6 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RASGRP4Q8TDF6 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RASGRP4Q8TDF6 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RASGRP4Q8TDF6 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RASGRP4Q8TDF6 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RASGRP4Q8TDF6 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RASGRP4Q8TDF6 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RASGRP4Q8TDF6 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RASGRP4Q8TDF6 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RASGRP4Q8TDF6 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RASGRP4Q8TDF6 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RASGRP4Q8TDF6 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RASGRP4Q8TDF6 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RASGRP4Q8TDF6 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RASGRP4Q8TDF6 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RASGRP4Q8TDF6 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RASGRP4Q8TDF6 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RASGRP4Q8TDF6 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RASGRP4Q8TDF6 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RASGRP4Q8TDF6 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RASGRP4Q8TDF6 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
RASGRP4Q8TDF6 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
RASGRP4Q8TDF6 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RASGRP4Q8TDF6 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RASGRP4Q8TDF6 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RASGRP4Q8TDF6 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RASGRP4Q8TDF6 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RASGRP4Q8TDF6 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RASGRP4Q8TDF6 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RASGRP4Q8TDF6 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RASGRP4Q8TDF6 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RASGRP4Q8TDF6 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RASGRP4Q8TDF6 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RASGRP4Q8TDF6 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RASGRP4Q8TDF6 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RASGRP4Q8TDF6 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RASGRP4Q8TDF6 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RASGRP4Q8TDF6 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RASGRP4Q8TDF6 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
RASGRP4Q8TDF6 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RASGRP4Q8TDF6 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RASGRP4Q8TDF6 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RASGRP4Q8TDF6 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RASGRP4Q8TDF6 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RASGRP4Q8TDF6 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RASGRP4Q8TDF6 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
RASGRP4Q8TDF6 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RASGRP4Q8TDF6 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RASGRP4Q8TDF6 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RASGRP4Q8TDF6 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
RASGRP4Q8TDF6 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RASGRP4Q8TDF6 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RASGRP4Q8TDF6 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RASGRP4Q8TDF6 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RASGRP4Q8TDF6 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RASGRP4Q8TDF6 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RASGRP4Q8TDF6 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RASGRP4Q8TDF6 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RASGRP4Q8TDF6 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RASGRP4Q8TDF6 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RASGRP4Q8TDF6 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RASGRP4Q8TDF6 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RASGRP4Q8TDF6 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RASGRP4Q8TDF6 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
RASGRP4Q8TDF6 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RASGRP4Q8TDF6 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RASGRP4Q8TDF6 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RASGRP4Q8TDF6 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RASGRP4Q8TDF6 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RASGRP4Q8TDF6 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RASGRP4Q8TDF6 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RASGRP4Q8TDF6 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RASGRP4Q8TDF6 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RASGRP4Q8TDF6 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RASGRP4Q8TDF6 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RASGRP4Q8TDF6 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RASGRP4Q8TDF6 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RASGRP4Q8TDF6 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RASGRP4Q8TDF6 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RASGRP4Q8TDF6 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RASGRP4Q8TDF6 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RASGRP4Q8TDF6 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RASGRP4Q8TDF6 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RASGRP4Q8TDF6 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RASGRP4Q8TDF6 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RASGRP4Q8TDF6 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RASGRP4Q8TDF6 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RASGRP4Q8TDF6 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RASGRP4Q8TDF6 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
RASGRP4Q8TDF6 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RASGRP4Q8TDF6 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RASGRP4Q8TDF6 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RASGRP4Q8TDF6 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RASGRP4Q8TDF6 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RASGRP4Q8TDF6 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RASGRP4Q8TDF6 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RASGRP4Q8TDF6 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RASGRP4Q8TDF6 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RASGRP4Q8TDF6 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms