Protein–RNA interactions for Protein: Q8TD19

NEK9, Serine/threonine-protein kinase Nek9, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK9Q8TD19 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NEK9Q8TD19 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NEK9Q8TD19 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NEK9Q8TD19 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NEK9Q8TD19 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NEK9Q8TD19 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NEK9Q8TD19 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
NEK9Q8TD19 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NEK9Q8TD19 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NEK9Q8TD19 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NEK9Q8TD19 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEK9Q8TD19 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEK9Q8TD19 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEK9Q8TD19 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEK9Q8TD19 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEK9Q8TD19 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEK9Q8TD19 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEK9Q8TD19 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
NEK9Q8TD19 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEK9Q8TD19 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEK9Q8TD19 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEK9Q8TD19 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NEK9Q8TD19 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NEK9Q8TD19 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NEK9Q8TD19 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NEK9Q8TD19 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NEK9Q8TD19 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NEK9Q8TD19 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
NEK9Q8TD19 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
NEK9Q8TD19 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NEK9Q8TD19 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NEK9Q8TD19 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
NEK9Q8TD19 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
NEK9Q8TD19 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NEK9Q8TD19 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NEK9Q8TD19 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NEK9Q8TD19 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NEK9Q8TD19 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NEK9Q8TD19 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NEK9Q8TD19 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NEK9Q8TD19 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NEK9Q8TD19 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NEK9Q8TD19 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NEK9Q8TD19 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NEK9Q8TD19 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
NEK9Q8TD19 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
NEK9Q8TD19 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
NEK9Q8TD19 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NEK9Q8TD19 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NEK9Q8TD19 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NEK9Q8TD19 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NEK9Q8TD19 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
NEK9Q8TD19 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NEK9Q8TD19 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NEK9Q8TD19 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NEK9Q8TD19 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NEK9Q8TD19 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NEK9Q8TD19 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NEK9Q8TD19 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NEK9Q8TD19 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NEK9Q8TD19 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NEK9Q8TD19 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NEK9Q8TD19 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NEK9Q8TD19 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NEK9Q8TD19 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NEK9Q8TD19 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
NEK9Q8TD19 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NEK9Q8TD19 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
NEK9Q8TD19 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NEK9Q8TD19 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NEK9Q8TD19 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NEK9Q8TD19 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
NEK9Q8TD19 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NEK9Q8TD19 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NEK9Q8TD19 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NEK9Q8TD19 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NEK9Q8TD19 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NEK9Q8TD19 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
NEK9Q8TD19 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NEK9Q8TD19 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NEK9Q8TD19 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NEK9Q8TD19 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NEK9Q8TD19 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NEK9Q8TD19 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NEK9Q8TD19 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NEK9Q8TD19 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NEK9Q8TD19 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NEK9Q8TD19 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NEK9Q8TD19 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NEK9Q8TD19 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NEK9Q8TD19 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NEK9Q8TD19 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NEK9Q8TD19 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NEK9Q8TD19 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NEK9Q8TD19 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NEK9Q8TD19 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NEK9Q8TD19 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NEK9Q8TD19 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NEK9Q8TD19 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NEK9Q8TD19 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
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