Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHM5

KDM2B, Lysine-specific demethylase 2B, humanhuman

Predictions only

Length 1,336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM2BQ8NHM5 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
KDM2BQ8NHM5 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
KDM2BQ8NHM5 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
KDM2BQ8NHM5 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
KDM2BQ8NHM5 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
KDM2BQ8NHM5 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
KDM2BQ8NHM5 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
KDM2BQ8NHM5 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.25
KDM2BQ8NHM5 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
KDM2BQ8NHM5 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
KDM2BQ8NHM5 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
KDM2BQ8NHM5 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
KDM2BQ8NHM5 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
KDM2BQ8NHM5 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
KDM2BQ8NHM5 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
KDM2BQ8NHM5 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
KDM2BQ8NHM5 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
KDM2BQ8NHM5 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
KDM2BQ8NHM5 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
KDM2BQ8NHM5 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
KDM2BQ8NHM5 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
KDM2BQ8NHM5 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
KDM2BQ8NHM5 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
KDM2BQ8NHM5 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
KDM2BQ8NHM5 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
KDM2BQ8NHM5 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
KDM2BQ8NHM5 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
KDM2BQ8NHM5 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
KDM2BQ8NHM5 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
KDM2BQ8NHM5 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
KDM2BQ8NHM5 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
KDM2BQ8NHM5 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
KDM2BQ8NHM5 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
KDM2BQ8NHM5 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
KDM2BQ8NHM5 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
KDM2BQ8NHM5 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
KDM2BQ8NHM5 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
KDM2BQ8NHM5 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
KDM2BQ8NHM5 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
KDM2BQ8NHM5 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
KDM2BQ8NHM5 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
KDM2BQ8NHM5 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
KDM2BQ8NHM5 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
KDM2BQ8NHM5 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
KDM2BQ8NHM5 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
KDM2BQ8NHM5 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
KDM2BQ8NHM5 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
KDM2BQ8NHM5 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
KDM2BQ8NHM5 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
KDM2BQ8NHM5 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
KDM2BQ8NHM5 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
KDM2BQ8NHM5 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
KDM2BQ8NHM5 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
KDM2BQ8NHM5 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
KDM2BQ8NHM5 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
KDM2BQ8NHM5 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
KDM2BQ8NHM5 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
KDM2BQ8NHM5 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
KDM2BQ8NHM5 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
KDM2BQ8NHM5 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
KDM2BQ8NHM5 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
KDM2BQ8NHM5 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
KDM2BQ8NHM5 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
KDM2BQ8NHM5 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
KDM2BQ8NHM5 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
KDM2BQ8NHM5 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
KDM2BQ8NHM5 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
KDM2BQ8NHM5 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
KDM2BQ8NHM5 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
KDM2BQ8NHM5 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
KDM2BQ8NHM5 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
KDM2BQ8NHM5 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
KDM2BQ8NHM5 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
KDM2BQ8NHM5 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
KDM2BQ8NHM5 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
KDM2BQ8NHM5 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
KDM2BQ8NHM5 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
KDM2BQ8NHM5 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
KDM2BQ8NHM5 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
KDM2BQ8NHM5 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
KDM2BQ8NHM5 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
KDM2BQ8NHM5 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
KDM2BQ8NHM5 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
KDM2BQ8NHM5 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
KDM2BQ8NHM5 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
KDM2BQ8NHM5 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
KDM2BQ8NHM5 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
KDM2BQ8NHM5 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
KDM2BQ8NHM5 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
KDM2BQ8NHM5 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
KDM2BQ8NHM5 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
KDM2BQ8NHM5 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
KDM2BQ8NHM5 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
KDM2BQ8NHM5 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
KDM2BQ8NHM5 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
KDM2BQ8NHM5 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
KDM2BQ8NHM5 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
KDM2BQ8NHM5 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
KDM2BQ8NHM5 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
KDM2BQ8NHM5 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms