Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFR7

CCDC148, Coiled-coil domain-containing protein 148, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC148Q8NFR7 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC148Q8NFR7 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC148Q8NFR7 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC148Q8NFR7 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC148Q8NFR7 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC148Q8NFR7 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC148Q8NFR7 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC148Q8NFR7 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC148Q8NFR7 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC148Q8NFR7 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC148Q8NFR7 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC148Q8NFR7 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC148Q8NFR7 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC148Q8NFR7 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC148Q8NFR7 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC148Q8NFR7 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC148Q8NFR7 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC148Q8NFR7 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC148Q8NFR7 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC148Q8NFR7 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CCDC148Q8NFR7 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC148Q8NFR7 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC148Q8NFR7 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC148Q8NFR7 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC148Q8NFR7 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC148Q8NFR7 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC148Q8NFR7 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC148Q8NFR7 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC148Q8NFR7 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC148Q8NFR7 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC148Q8NFR7 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC148Q8NFR7 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC148Q8NFR7 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC148Q8NFR7 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC148Q8NFR7 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC148Q8NFR7 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC148Q8NFR7 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC148Q8NFR7 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC148Q8NFR7 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC148Q8NFR7 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC148Q8NFR7 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC148Q8NFR7 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC148Q8NFR7 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC148Q8NFR7 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC148Q8NFR7 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC148Q8NFR7 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC148Q8NFR7 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC148Q8NFR7 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC148Q8NFR7 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC148Q8NFR7 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC148Q8NFR7 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC148Q8NFR7 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC148Q8NFR7 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC148Q8NFR7 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC148Q8NFR7 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC148Q8NFR7 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC148Q8NFR7 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC148Q8NFR7 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC148Q8NFR7 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC148Q8NFR7 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC148Q8NFR7 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC148Q8NFR7 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC148Q8NFR7 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC148Q8NFR7 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC148Q8NFR7 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC148Q8NFR7 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC148Q8NFR7 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC148Q8NFR7 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC148Q8NFR7 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC148Q8NFR7 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC148Q8NFR7 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC148Q8NFR7 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC148Q8NFR7 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC148Q8NFR7 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC148Q8NFR7 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC148Q8NFR7 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC148Q8NFR7 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC148Q8NFR7 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC148Q8NFR7 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC148Q8NFR7 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CCDC148Q8NFR7 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CCDC148Q8NFR7 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC148Q8NFR7 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC148Q8NFR7 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC148Q8NFR7 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC148Q8NFR7 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC148Q8NFR7 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC148Q8NFR7 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC148Q8NFR7 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC148Q8NFR7 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC148Q8NFR7 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC148Q8NFR7 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC148Q8NFR7 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC148Q8NFR7 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC148Q8NFR7 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC148Q8NFR7 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC148Q8NFR7 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC148Q8NFR7 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC148Q8NFR7 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC148Q8NFR7 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms