Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU1

CCDC197, Putative uncharacterized protein CCDC197, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC197Q8NCU1 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC197Q8NCU1 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC197Q8NCU1 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC197Q8NCU1 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC197Q8NCU1 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC197Q8NCU1 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC197Q8NCU1 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC197Q8NCU1 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC197Q8NCU1 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC197Q8NCU1 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC197Q8NCU1 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC197Q8NCU1 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC197Q8NCU1 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC197Q8NCU1 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC197Q8NCU1 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC197Q8NCU1 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC197Q8NCU1 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC197Q8NCU1 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC197Q8NCU1 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC197Q8NCU1 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC197Q8NCU1 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC197Q8NCU1 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC197Q8NCU1 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC197Q8NCU1 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC197Q8NCU1 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC197Q8NCU1 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC197Q8NCU1 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC197Q8NCU1 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC197Q8NCU1 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC197Q8NCU1 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC197Q8NCU1 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC197Q8NCU1 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC197Q8NCU1 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC197Q8NCU1 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC197Q8NCU1 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC197Q8NCU1 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC197Q8NCU1 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC197Q8NCU1 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC197Q8NCU1 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC197Q8NCU1 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC197Q8NCU1 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC197Q8NCU1 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC197Q8NCU1 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC197Q8NCU1 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC197Q8NCU1 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC197Q8NCU1 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC197Q8NCU1 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC197Q8NCU1 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC197Q8NCU1 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC197Q8NCU1 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC197Q8NCU1 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC197Q8NCU1 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC197Q8NCU1 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC197Q8NCU1 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC197Q8NCU1 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC197Q8NCU1 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC197Q8NCU1 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC197Q8NCU1 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC197Q8NCU1 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC197Q8NCU1 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC197Q8NCU1 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC197Q8NCU1 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC197Q8NCU1 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC197Q8NCU1 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC197Q8NCU1 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC197Q8NCU1 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC197Q8NCU1 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC197Q8NCU1 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC197Q8NCU1 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC197Q8NCU1 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC197Q8NCU1 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC197Q8NCU1 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC197Q8NCU1 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC197Q8NCU1 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC197Q8NCU1 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC197Q8NCU1 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC197Q8NCU1 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC197Q8NCU1 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC197Q8NCU1 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC197Q8NCU1 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC197Q8NCU1 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC197Q8NCU1 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC197Q8NCU1 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC197Q8NCU1 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC197Q8NCU1 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC197Q8NCU1 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC197Q8NCU1 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC197Q8NCU1 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC197Q8NCU1 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC197Q8NCU1 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC197Q8NCU1 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC197Q8NCU1 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC197Q8NCU1 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC197Q8NCU1 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC197Q8NCU1 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC197Q8NCU1 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC197Q8NCU1 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC197Q8NCU1 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC197Q8NCU1 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC197Q8NCU1 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms