Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCL9

APCDD1L, Protein APCDD1-like, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APCDD1LQ8NCL9 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
APCDD1LQ8NCL9 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
APCDD1LQ8NCL9 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
APCDD1LQ8NCL9 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
APCDD1LQ8NCL9 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
APCDD1LQ8NCL9 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
APCDD1LQ8NCL9 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
APCDD1LQ8NCL9 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
APCDD1LQ8NCL9 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
APCDD1LQ8NCL9 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
APCDD1LQ8NCL9 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
APCDD1LQ8NCL9 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
APCDD1LQ8NCL9 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
APCDD1LQ8NCL9 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
APCDD1LQ8NCL9 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
APCDD1LQ8NCL9 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
APCDD1LQ8NCL9 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
APCDD1LQ8NCL9 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
APCDD1LQ8NCL9 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
APCDD1LQ8NCL9 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
APCDD1LQ8NCL9 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
APCDD1LQ8NCL9 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
APCDD1LQ8NCL9 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
APCDD1LQ8NCL9 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
APCDD1LQ8NCL9 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
APCDD1LQ8NCL9 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
APCDD1LQ8NCL9 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
APCDD1LQ8NCL9 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
APCDD1LQ8NCL9 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
APCDD1LQ8NCL9 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
APCDD1LQ8NCL9 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
APCDD1LQ8NCL9 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
APCDD1LQ8NCL9 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
APCDD1LQ8NCL9 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
APCDD1LQ8NCL9 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
APCDD1LQ8NCL9 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
APCDD1LQ8NCL9 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
APCDD1LQ8NCL9 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
APCDD1LQ8NCL9 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
APCDD1LQ8NCL9 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
APCDD1LQ8NCL9 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
APCDD1LQ8NCL9 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
APCDD1LQ8NCL9 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
APCDD1LQ8NCL9 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
APCDD1LQ8NCL9 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
APCDD1LQ8NCL9 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
APCDD1LQ8NCL9 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
APCDD1LQ8NCL9 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
APCDD1LQ8NCL9 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
APCDD1LQ8NCL9 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
APCDD1LQ8NCL9 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
APCDD1LQ8NCL9 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
APCDD1LQ8NCL9 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
APCDD1LQ8NCL9 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
APCDD1LQ8NCL9 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
APCDD1LQ8NCL9 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
APCDD1LQ8NCL9 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
APCDD1LQ8NCL9 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
APCDD1LQ8NCL9 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
APCDD1LQ8NCL9 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
APCDD1LQ8NCL9 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
APCDD1LQ8NCL9 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
APCDD1LQ8NCL9 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
APCDD1LQ8NCL9 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
APCDD1LQ8NCL9 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
APCDD1LQ8NCL9 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
APCDD1LQ8NCL9 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
APCDD1LQ8NCL9 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
APCDD1LQ8NCL9 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
APCDD1LQ8NCL9 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
APCDD1LQ8NCL9 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
APCDD1LQ8NCL9 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
APCDD1LQ8NCL9 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
APCDD1LQ8NCL9 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
APCDD1LQ8NCL9 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
APCDD1LQ8NCL9 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
APCDD1LQ8NCL9 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
APCDD1LQ8NCL9 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
APCDD1LQ8NCL9 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
APCDD1LQ8NCL9 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
APCDD1LQ8NCL9 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
APCDD1LQ8NCL9 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
APCDD1LQ8NCL9 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
APCDD1LQ8NCL9 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
APCDD1LQ8NCL9 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
APCDD1LQ8NCL9 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
APCDD1LQ8NCL9 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
APCDD1LQ8NCL9 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
APCDD1LQ8NCL9 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
APCDD1LQ8NCL9 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
APCDD1LQ8NCL9 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
APCDD1LQ8NCL9 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
APCDD1LQ8NCL9 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
APCDD1LQ8NCL9 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
APCDD1LQ8NCL9 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
APCDD1LQ8NCL9 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
APCDD1LQ8NCL9 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
APCDD1LQ8NCL9 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
APCDD1LQ8NCL9 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
APCDD1LQ8NCL9 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms