Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA56

TTC29, Tetratricopeptide repeat protein 29, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC29Q8NA56 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TTC29Q8NA56 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TTC29Q8NA56 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TTC29Q8NA56 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
TTC29Q8NA56 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TTC29Q8NA56 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TTC29Q8NA56 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TTC29Q8NA56 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
TTC29Q8NA56 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TTC29Q8NA56 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TTC29Q8NA56 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TTC29Q8NA56 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TTC29Q8NA56 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TTC29Q8NA56 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TTC29Q8NA56 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TTC29Q8NA56 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TTC29Q8NA56 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TTC29Q8NA56 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TTC29Q8NA56 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TTC29Q8NA56 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TTC29Q8NA56 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TTC29Q8NA56 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TTC29Q8NA56 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TTC29Q8NA56 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TTC29Q8NA56 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TTC29Q8NA56 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TTC29Q8NA56 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TTC29Q8NA56 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TTC29Q8NA56 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TTC29Q8NA56 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
TTC29Q8NA56 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TTC29Q8NA56 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TTC29Q8NA56 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TTC29Q8NA56 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TTC29Q8NA56 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TTC29Q8NA56 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TTC29Q8NA56 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TTC29Q8NA56 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TTC29Q8NA56 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TTC29Q8NA56 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TTC29Q8NA56 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TTC29Q8NA56 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TTC29Q8NA56 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TTC29Q8NA56 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TTC29Q8NA56 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TTC29Q8NA56 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TTC29Q8NA56 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TTC29Q8NA56 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TTC29Q8NA56 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TTC29Q8NA56 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TTC29Q8NA56 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TTC29Q8NA56 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TTC29Q8NA56 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TTC29Q8NA56 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TTC29Q8NA56 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TTC29Q8NA56 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TTC29Q8NA56 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TTC29Q8NA56 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TTC29Q8NA56 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TTC29Q8NA56 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TTC29Q8NA56 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TTC29Q8NA56 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TTC29Q8NA56 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TTC29Q8NA56 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TTC29Q8NA56 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TTC29Q8NA56 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TTC29Q8NA56 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TTC29Q8NA56 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TTC29Q8NA56 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TTC29Q8NA56 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TTC29Q8NA56 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TTC29Q8NA56 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TTC29Q8NA56 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TTC29Q8NA56 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TTC29Q8NA56 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TTC29Q8NA56 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TTC29Q8NA56 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TTC29Q8NA56 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TTC29Q8NA56 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TTC29Q8NA56 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TTC29Q8NA56 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TTC29Q8NA56 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TTC29Q8NA56 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TTC29Q8NA56 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TTC29Q8NA56 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TTC29Q8NA56 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TTC29Q8NA56 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TTC29Q8NA56 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TTC29Q8NA56 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TTC29Q8NA56 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TTC29Q8NA56 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TTC29Q8NA56 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TTC29Q8NA56 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TTC29Q8NA56 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TTC29Q8NA56 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TTC29Q8NA56 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TTC29Q8NA56 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TTC29Q8NA56 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TTC29Q8NA56 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TTC29Q8NA56 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
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