Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA47

CCDC63, Coiled-coil domain-containing protein 63, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC63Q8NA47 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC63Q8NA47 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC63Q8NA47 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC63Q8NA47 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC63Q8NA47 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC63Q8NA47 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC63Q8NA47 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC63Q8NA47 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC63Q8NA47 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC63Q8NA47 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCDC63Q8NA47 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCDC63Q8NA47 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC63Q8NA47 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC63Q8NA47 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC63Q8NA47 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC63Q8NA47 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC63Q8NA47 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC63Q8NA47 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC63Q8NA47 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC63Q8NA47 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC63Q8NA47 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC63Q8NA47 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC63Q8NA47 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC63Q8NA47 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC63Q8NA47 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC63Q8NA47 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC63Q8NA47 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC63Q8NA47 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC63Q8NA47 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC63Q8NA47 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC63Q8NA47 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC63Q8NA47 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC63Q8NA47 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC63Q8NA47 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC63Q8NA47 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC63Q8NA47 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC63Q8NA47 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC63Q8NA47 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC63Q8NA47 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC63Q8NA47 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC63Q8NA47 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC63Q8NA47 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC63Q8NA47 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC63Q8NA47 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC63Q8NA47 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC63Q8NA47 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC63Q8NA47 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC63Q8NA47 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC63Q8NA47 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC63Q8NA47 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC63Q8NA47 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC63Q8NA47 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC63Q8NA47 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC63Q8NA47 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC63Q8NA47 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC63Q8NA47 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC63Q8NA47 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC63Q8NA47 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC63Q8NA47 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC63Q8NA47 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC63Q8NA47 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC63Q8NA47 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC63Q8NA47 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC63Q8NA47 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC63Q8NA47 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC63Q8NA47 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC63Q8NA47 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC63Q8NA47 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC63Q8NA47 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC63Q8NA47 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC63Q8NA47 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC63Q8NA47 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC63Q8NA47 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC63Q8NA47 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC63Q8NA47 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC63Q8NA47 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC63Q8NA47 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC63Q8NA47 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC63Q8NA47 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC63Q8NA47 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC63Q8NA47 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC63Q8NA47 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC63Q8NA47 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC63Q8NA47 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC63Q8NA47 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC63Q8NA47 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC63Q8NA47 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC63Q8NA47 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC63Q8NA47 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC63Q8NA47 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC63Q8NA47 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC63Q8NA47 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC63Q8NA47 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC63Q8NA47 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC63Q8NA47 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC63Q8NA47 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC63Q8NA47 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC63Q8NA47 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC63Q8NA47 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC63Q8NA47 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms