Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3U4

STAG2, Cohesin subunit SA-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAG2Q8N3U4 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
STAG2Q8N3U4 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
STAG2Q8N3U4 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
STAG2Q8N3U4 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
STAG2Q8N3U4 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
STAG2Q8N3U4 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
STAG2Q8N3U4 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
STAG2Q8N3U4 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
STAG2Q8N3U4 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
STAG2Q8N3U4 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
STAG2Q8N3U4 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
STAG2Q8N3U4 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
STAG2Q8N3U4 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
STAG2Q8N3U4 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
STAG2Q8N3U4 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
STAG2Q8N3U4 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
STAG2Q8N3U4 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
STAG2Q8N3U4 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
STAG2Q8N3U4 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
STAG2Q8N3U4 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
STAG2Q8N3U4 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
STAG2Q8N3U4 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
STAG2Q8N3U4 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
STAG2Q8N3U4 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
STAG2Q8N3U4 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
STAG2Q8N3U4 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
STAG2Q8N3U4 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
STAG2Q8N3U4 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
STAG2Q8N3U4 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
STAG2Q8N3U4 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
STAG2Q8N3U4 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
STAG2Q8N3U4 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
STAG2Q8N3U4 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
STAG2Q8N3U4 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
STAG2Q8N3U4 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
STAG2Q8N3U4 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
STAG2Q8N3U4 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
STAG2Q8N3U4 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
STAG2Q8N3U4 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
STAG2Q8N3U4 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
STAG2Q8N3U4 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
STAG2Q8N3U4 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
STAG2Q8N3U4 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
STAG2Q8N3U4 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
STAG2Q8N3U4 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
STAG2Q8N3U4 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
STAG2Q8N3U4 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
STAG2Q8N3U4 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
STAG2Q8N3U4 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
STAG2Q8N3U4 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
STAG2Q8N3U4 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
STAG2Q8N3U4 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
STAG2Q8N3U4 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
STAG2Q8N3U4 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
STAG2Q8N3U4 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
STAG2Q8N3U4 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
STAG2Q8N3U4 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
STAG2Q8N3U4 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
STAG2Q8N3U4 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
STAG2Q8N3U4 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
STAG2Q8N3U4 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
STAG2Q8N3U4 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
STAG2Q8N3U4 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
STAG2Q8N3U4 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
STAG2Q8N3U4 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
STAG2Q8N3U4 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
STAG2Q8N3U4 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
STAG2Q8N3U4 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
STAG2Q8N3U4 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
STAG2Q8N3U4 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
STAG2Q8N3U4 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
STAG2Q8N3U4 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
STAG2Q8N3U4 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
STAG2Q8N3U4 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
STAG2Q8N3U4 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
STAG2Q8N3U4 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
STAG2Q8N3U4 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
STAG2Q8N3U4 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
STAG2Q8N3U4 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
STAG2Q8N3U4 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
STAG2Q8N3U4 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
STAG2Q8N3U4 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
STAG2Q8N3U4 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
STAG2Q8N3U4 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
STAG2Q8N3U4 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
STAG2Q8N3U4 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
STAG2Q8N3U4 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
STAG2Q8N3U4 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
STAG2Q8N3U4 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
STAG2Q8N3U4 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
STAG2Q8N3U4 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
STAG2Q8N3U4 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
STAG2Q8N3U4 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
STAG2Q8N3U4 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
STAG2Q8N3U4 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
STAG2Q8N3U4 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
STAG2Q8N3U4 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
STAG2Q8N3U4 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
STAG2Q8N3U4 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
STAG2Q8N3U4 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms