Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZ73

RPUSD2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 545 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD2Q8IZ73 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RPUSD2Q8IZ73 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RPUSD2Q8IZ73 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RPUSD2Q8IZ73 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
RPUSD2Q8IZ73 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RPUSD2Q8IZ73 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RPUSD2Q8IZ73 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RPUSD2Q8IZ73 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RPUSD2Q8IZ73 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RPUSD2Q8IZ73 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
RPUSD2Q8IZ73 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RPUSD2Q8IZ73 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RPUSD2Q8IZ73 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RPUSD2Q8IZ73 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RPUSD2Q8IZ73 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RPUSD2Q8IZ73 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RPUSD2Q8IZ73 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
RPUSD2Q8IZ73 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RPUSD2Q8IZ73 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RPUSD2Q8IZ73 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RPUSD2Q8IZ73 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RPUSD2Q8IZ73 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RPUSD2Q8IZ73 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
RPUSD2Q8IZ73 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RPUSD2Q8IZ73 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RPUSD2Q8IZ73 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RPUSD2Q8IZ73 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
RPUSD2Q8IZ73 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
RPUSD2Q8IZ73 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
RPUSD2Q8IZ73 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
RPUSD2Q8IZ73 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
RPUSD2Q8IZ73 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RPUSD2Q8IZ73 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RPUSD2Q8IZ73 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RPUSD2Q8IZ73 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RPUSD2Q8IZ73 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RPUSD2Q8IZ73 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RPUSD2Q8IZ73 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
RPUSD2Q8IZ73 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RPUSD2Q8IZ73 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RPUSD2Q8IZ73 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RPUSD2Q8IZ73 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RPUSD2Q8IZ73 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RPUSD2Q8IZ73 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RPUSD2Q8IZ73 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RPUSD2Q8IZ73 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RPUSD2Q8IZ73 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RPUSD2Q8IZ73 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RPUSD2Q8IZ73 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RPUSD2Q8IZ73 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RPUSD2Q8IZ73 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RPUSD2Q8IZ73 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RPUSD2Q8IZ73 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RPUSD2Q8IZ73 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RPUSD2Q8IZ73 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RPUSD2Q8IZ73 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RPUSD2Q8IZ73 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
RPUSD2Q8IZ73 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RPUSD2Q8IZ73 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RPUSD2Q8IZ73 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RPUSD2Q8IZ73 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RPUSD2Q8IZ73 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RPUSD2Q8IZ73 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RPUSD2Q8IZ73 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RPUSD2Q8IZ73 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RPUSD2Q8IZ73 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RPUSD2Q8IZ73 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RPUSD2Q8IZ73 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RPUSD2Q8IZ73 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RPUSD2Q8IZ73 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RPUSD2Q8IZ73 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RPUSD2Q8IZ73 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RPUSD2Q8IZ73 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RPUSD2Q8IZ73 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RPUSD2Q8IZ73 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RPUSD2Q8IZ73 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RPUSD2Q8IZ73 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RPUSD2Q8IZ73 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RPUSD2Q8IZ73 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RPUSD2Q8IZ73 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RPUSD2Q8IZ73 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RPUSD2Q8IZ73 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RPUSD2Q8IZ73 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RPUSD2Q8IZ73 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RPUSD2Q8IZ73 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RPUSD2Q8IZ73 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RPUSD2Q8IZ73 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RPUSD2Q8IZ73 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RPUSD2Q8IZ73 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RPUSD2Q8IZ73 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RPUSD2Q8IZ73 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RPUSD2Q8IZ73 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
RPUSD2Q8IZ73 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
RPUSD2Q8IZ73 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RPUSD2Q8IZ73 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RPUSD2Q8IZ73 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RPUSD2Q8IZ73 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RPUSD2Q8IZ73 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RPUSD2Q8IZ73 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RPUSD2Q8IZ73 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms