Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWD4

CCDC117, Coiled-coil domain-containing protein 117, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC117Q8IWD4 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC117Q8IWD4 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC117Q8IWD4 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC117Q8IWD4 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC117Q8IWD4 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC117Q8IWD4 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC117Q8IWD4 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC117Q8IWD4 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC117Q8IWD4 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC117Q8IWD4 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC117Q8IWD4 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC117Q8IWD4 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC117Q8IWD4 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC117Q8IWD4 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC117Q8IWD4 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC117Q8IWD4 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC117Q8IWD4 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC117Q8IWD4 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC117Q8IWD4 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC117Q8IWD4 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC117Q8IWD4 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC117Q8IWD4 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC117Q8IWD4 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC117Q8IWD4 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC117Q8IWD4 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC117Q8IWD4 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC117Q8IWD4 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC117Q8IWD4 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC117Q8IWD4 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC117Q8IWD4 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC117Q8IWD4 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC117Q8IWD4 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC117Q8IWD4 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC117Q8IWD4 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC117Q8IWD4 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC117Q8IWD4 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC117Q8IWD4 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC117Q8IWD4 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC117Q8IWD4 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC117Q8IWD4 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC117Q8IWD4 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC117Q8IWD4 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC117Q8IWD4 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC117Q8IWD4 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC117Q8IWD4 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC117Q8IWD4 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC117Q8IWD4 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC117Q8IWD4 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC117Q8IWD4 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC117Q8IWD4 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC117Q8IWD4 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC117Q8IWD4 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC117Q8IWD4 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC117Q8IWD4 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC117Q8IWD4 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC117Q8IWD4 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC117Q8IWD4 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC117Q8IWD4 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC117Q8IWD4 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC117Q8IWD4 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC117Q8IWD4 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC117Q8IWD4 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC117Q8IWD4 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC117Q8IWD4 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC117Q8IWD4 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC117Q8IWD4 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC117Q8IWD4 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC117Q8IWD4 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC117Q8IWD4 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC117Q8IWD4 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC117Q8IWD4 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC117Q8IWD4 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC117Q8IWD4 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC117Q8IWD4 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC117Q8IWD4 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC117Q8IWD4 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC117Q8IWD4 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC117Q8IWD4 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC117Q8IWD4 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC117Q8IWD4 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC117Q8IWD4 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC117Q8IWD4 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC117Q8IWD4 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC117Q8IWD4 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC117Q8IWD4 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC117Q8IWD4 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC117Q8IWD4 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC117Q8IWD4 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC117Q8IWD4 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC117Q8IWD4 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC117Q8IWD4 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC117Q8IWD4 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC117Q8IWD4 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC117Q8IWD4 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC117Q8IWD4 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC117Q8IWD4 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC117Q8IWD4 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC117Q8IWD4 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC117Q8IWD4 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC117Q8IWD4 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms