Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV35

WDR49, WD repeat-containing protein 49, humanhuman

Predictions only

Length 697 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR49Q8IV35 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
WDR49Q8IV35 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
WDR49Q8IV35 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
WDR49Q8IV35 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
WDR49Q8IV35 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
WDR49Q8IV35 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
WDR49Q8IV35 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
WDR49Q8IV35 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
WDR49Q8IV35 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
WDR49Q8IV35 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
WDR49Q8IV35 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
WDR49Q8IV35 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
WDR49Q8IV35 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
WDR49Q8IV35 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
WDR49Q8IV35 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
WDR49Q8IV35 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
WDR49Q8IV35 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
WDR49Q8IV35 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
WDR49Q8IV35 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
WDR49Q8IV35 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
WDR49Q8IV35 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
WDR49Q8IV35 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
WDR49Q8IV35 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
WDR49Q8IV35 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
WDR49Q8IV35 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
WDR49Q8IV35 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
WDR49Q8IV35 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
WDR49Q8IV35 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
WDR49Q8IV35 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
WDR49Q8IV35 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
WDR49Q8IV35 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
WDR49Q8IV35 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
WDR49Q8IV35 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
WDR49Q8IV35 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
WDR49Q8IV35 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
WDR49Q8IV35 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
WDR49Q8IV35 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
WDR49Q8IV35 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
WDR49Q8IV35 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
WDR49Q8IV35 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
WDR49Q8IV35 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
WDR49Q8IV35 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
WDR49Q8IV35 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
WDR49Q8IV35 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
WDR49Q8IV35 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
WDR49Q8IV35 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
WDR49Q8IV35 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
WDR49Q8IV35 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
WDR49Q8IV35 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
WDR49Q8IV35 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
WDR49Q8IV35 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
WDR49Q8IV35 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
WDR49Q8IV35 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
WDR49Q8IV35 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
WDR49Q8IV35 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
WDR49Q8IV35 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
WDR49Q8IV35 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
WDR49Q8IV35 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
WDR49Q8IV35 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
WDR49Q8IV35 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
WDR49Q8IV35 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
WDR49Q8IV35 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
WDR49Q8IV35 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
WDR49Q8IV35 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
WDR49Q8IV35 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
WDR49Q8IV35 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
WDR49Q8IV35 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
WDR49Q8IV35 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
WDR49Q8IV35 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
WDR49Q8IV35 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
WDR49Q8IV35 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
WDR49Q8IV35 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
WDR49Q8IV35 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
WDR49Q8IV35 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
WDR49Q8IV35 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
WDR49Q8IV35 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
WDR49Q8IV35 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
WDR49Q8IV35 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
WDR49Q8IV35 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
WDR49Q8IV35 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
WDR49Q8IV35 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
WDR49Q8IV35 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
WDR49Q8IV35 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
WDR49Q8IV35 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
WDR49Q8IV35 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
WDR49Q8IV35 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
WDR49Q8IV35 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
WDR49Q8IV35 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
WDR49Q8IV35 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
WDR49Q8IV35 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
WDR49Q8IV35 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
WDR49Q8IV35 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
WDR49Q8IV35 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
WDR49Q8IV35 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
WDR49Q8IV35 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
WDR49Q8IV35 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
WDR49Q8IV35 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
WDR49Q8IV35 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
WDR49Q8IV35 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
WDR49Q8IV35 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms