Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV01

SYT12, Synaptotagmin-12, humanhuman

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT12Q8IV01 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYT12Q8IV01 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SYT12Q8IV01 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYT12Q8IV01 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYT12Q8IV01 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYT12Q8IV01 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYT12Q8IV01 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYT12Q8IV01 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYT12Q8IV01 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYT12Q8IV01 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SYT12Q8IV01 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYT12Q8IV01 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYT12Q8IV01 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYT12Q8IV01 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYT12Q8IV01 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYT12Q8IV01 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYT12Q8IV01 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYT12Q8IV01 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SYT12Q8IV01 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYT12Q8IV01 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYT12Q8IV01 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYT12Q8IV01 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYT12Q8IV01 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYT12Q8IV01 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYT12Q8IV01 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYT12Q8IV01 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYT12Q8IV01 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYT12Q8IV01 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SYT12Q8IV01 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYT12Q8IV01 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYT12Q8IV01 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SYT12Q8IV01 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYT12Q8IV01 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SYT12Q8IV01 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYT12Q8IV01 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYT12Q8IV01 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYT12Q8IV01 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYT12Q8IV01 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYT12Q8IV01 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYT12Q8IV01 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYT12Q8IV01 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYT12Q8IV01 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYT12Q8IV01 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYT12Q8IV01 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYT12Q8IV01 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYT12Q8IV01 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYT12Q8IV01 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYT12Q8IV01 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYT12Q8IV01 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYT12Q8IV01 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SYT12Q8IV01 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYT12Q8IV01 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYT12Q8IV01 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SYT12Q8IV01 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYT12Q8IV01 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYT12Q8IV01 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYT12Q8IV01 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYT12Q8IV01 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYT12Q8IV01 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYT12Q8IV01 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYT12Q8IV01 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYT12Q8IV01 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYT12Q8IV01 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYT12Q8IV01 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYT12Q8IV01 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYT12Q8IV01 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYT12Q8IV01 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYT12Q8IV01 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYT12Q8IV01 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYT12Q8IV01 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYT12Q8IV01 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYT12Q8IV01 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYT12Q8IV01 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYT12Q8IV01 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYT12Q8IV01 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYT12Q8IV01 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYT12Q8IV01 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYT12Q8IV01 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYT12Q8IV01 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYT12Q8IV01 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SYT12Q8IV01 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYT12Q8IV01 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYT12Q8IV01 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYT12Q8IV01 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SYT12Q8IV01 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SYT12Q8IV01 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SYT12Q8IV01 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYT12Q8IV01 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYT12Q8IV01 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYT12Q8IV01 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYT12Q8IV01 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYT12Q8IV01 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYT12Q8IV01 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYT12Q8IV01 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYT12Q8IV01 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYT12Q8IV01 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYT12Q8IV01 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYT12Q8IV01 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SYT12Q8IV01 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYT12Q8IV01 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms