Protein–RNA interactions for Protein: Q86X45

LRRC6, Protein tilB homolog, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC6Q86X45 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC6Q86X45 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC6Q86X45 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC6Q86X45 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC6Q86X45 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC6Q86X45 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC6Q86X45 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC6Q86X45 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC6Q86X45 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC6Q86X45 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC6Q86X45 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC6Q86X45 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC6Q86X45 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRC6Q86X45 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRC6Q86X45 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRC6Q86X45 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRC6Q86X45 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRC6Q86X45 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRC6Q86X45 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRC6Q86X45 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRC6Q86X45 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRC6Q86X45 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRC6Q86X45 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRC6Q86X45 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRC6Q86X45 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRC6Q86X45 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRC6Q86X45 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC6Q86X45 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC6Q86X45 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC6Q86X45 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC6Q86X45 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC6Q86X45 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC6Q86X45 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC6Q86X45 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC6Q86X45 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC6Q86X45 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC6Q86X45 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC6Q86X45 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC6Q86X45 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC6Q86X45 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC6Q86X45 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC6Q86X45 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC6Q86X45 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC6Q86X45 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC6Q86X45 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC6Q86X45 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC6Q86X45 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC6Q86X45 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC6Q86X45 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC6Q86X45 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC6Q86X45 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC6Q86X45 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC6Q86X45 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC6Q86X45 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC6Q86X45 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC6Q86X45 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC6Q86X45 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.23
LRRC6Q86X45 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC6Q86X45 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC6Q86X45 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC6Q86X45 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC6Q86X45 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC6Q86X45 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC6Q86X45 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC6Q86X45 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC6Q86X45 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC6Q86X45 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC6Q86X45 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC6Q86X45 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC6Q86X45 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC6Q86X45 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC6Q86X45 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC6Q86X45 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC6Q86X45 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC6Q86X45 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC6Q86X45 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC6Q86X45 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC6Q86X45 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC6Q86X45 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC6Q86X45 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC6Q86X45 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC6Q86X45 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC6Q86X45 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC6Q86X45 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC6Q86X45 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC6Q86X45 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC6Q86X45 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC6Q86X45 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC6Q86X45 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC6Q86X45 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC6Q86X45 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC6Q86X45 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC6Q86X45 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC6Q86X45 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC6Q86X45 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC6Q86X45 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC6Q86X45 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC6Q86X45 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC6Q86X45 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC6Q86X45 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms