Protein–RNA interactions for Protein: Q86UC2

RSPH3, Radial spoke head protein 3 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPH3Q86UC2 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RSPH3Q86UC2 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RSPH3Q86UC2 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RSPH3Q86UC2 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RSPH3Q86UC2 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RSPH3Q86UC2 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RSPH3Q86UC2 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RSPH3Q86UC2 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RSPH3Q86UC2 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RSPH3Q86UC2 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RSPH3Q86UC2 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RSPH3Q86UC2 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RSPH3Q86UC2 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RSPH3Q86UC2 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RSPH3Q86UC2 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RSPH3Q86UC2 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RSPH3Q86UC2 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RSPH3Q86UC2 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RSPH3Q86UC2 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RSPH3Q86UC2 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RSPH3Q86UC2 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RSPH3Q86UC2 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RSPH3Q86UC2 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RSPH3Q86UC2 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
RSPH3Q86UC2 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RSPH3Q86UC2 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RSPH3Q86UC2 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RSPH3Q86UC2 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RSPH3Q86UC2 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RSPH3Q86UC2 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RSPH3Q86UC2 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RSPH3Q86UC2 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RSPH3Q86UC2 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RSPH3Q86UC2 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RSPH3Q86UC2 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RSPH3Q86UC2 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RSPH3Q86UC2 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RSPH3Q86UC2 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RSPH3Q86UC2 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RSPH3Q86UC2 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RSPH3Q86UC2 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RSPH3Q86UC2 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
RSPH3Q86UC2 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RSPH3Q86UC2 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RSPH3Q86UC2 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RSPH3Q86UC2 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RSPH3Q86UC2 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RSPH3Q86UC2 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RSPH3Q86UC2 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RSPH3Q86UC2 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
RSPH3Q86UC2 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RSPH3Q86UC2 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RSPH3Q86UC2 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RSPH3Q86UC2 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RSPH3Q86UC2 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RSPH3Q86UC2 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RSPH3Q86UC2 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RSPH3Q86UC2 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RSPH3Q86UC2 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RSPH3Q86UC2 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
RSPH3Q86UC2 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RSPH3Q86UC2 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
RSPH3Q86UC2 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RSPH3Q86UC2 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RSPH3Q86UC2 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RSPH3Q86UC2 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RSPH3Q86UC2 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RSPH3Q86UC2 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RSPH3Q86UC2 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RSPH3Q86UC2 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
RSPH3Q86UC2 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RSPH3Q86UC2 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
RSPH3Q86UC2 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RSPH3Q86UC2 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RSPH3Q86UC2 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RSPH3Q86UC2 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RSPH3Q86UC2 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
RSPH3Q86UC2 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RSPH3Q86UC2 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RSPH3Q86UC2 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RSPH3Q86UC2 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RSPH3Q86UC2 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RSPH3Q86UC2 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RSPH3Q86UC2 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RSPH3Q86UC2 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RSPH3Q86UC2 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RSPH3Q86UC2 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RSPH3Q86UC2 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RSPH3Q86UC2 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RSPH3Q86UC2 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RSPH3Q86UC2 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RSPH3Q86UC2 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RSPH3Q86UC2 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RSPH3Q86UC2 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RSPH3Q86UC2 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RSPH3Q86UC2 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RSPH3Q86UC2 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RSPH3Q86UC2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RSPH3Q86UC2 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RSPH3Q86UC2 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms