Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z6B7

SRGAP1, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP1Q7Z6B7 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SRGAP1Q7Z6B7 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SRGAP1Q7Z6B7 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SRGAP1Q7Z6B7 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SRGAP1Q7Z6B7 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SRGAP1Q7Z6B7 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SRGAP1Q7Z6B7 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SRGAP1Q7Z6B7 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SRGAP1Q7Z6B7 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SRGAP1Q7Z6B7 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SRGAP1Q7Z6B7 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SRGAP1Q7Z6B7 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SRGAP1Q7Z6B7 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SRGAP1Q7Z6B7 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SRGAP1Q7Z6B7 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SRGAP1Q7Z6B7 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SRGAP1Q7Z6B7 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SRGAP1Q7Z6B7 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SRGAP1Q7Z6B7 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SRGAP1Q7Z6B7 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SRGAP1Q7Z6B7 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SRGAP1Q7Z6B7 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SRGAP1Q7Z6B7 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SRGAP1Q7Z6B7 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SRGAP1Q7Z6B7 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SRGAP1Q7Z6B7 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SRGAP1Q7Z6B7 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SRGAP1Q7Z6B7 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SRGAP1Q7Z6B7 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SRGAP1Q7Z6B7 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SRGAP1Q7Z6B7 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SRGAP1Q7Z6B7 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SRGAP1Q7Z6B7 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SRGAP1Q7Z6B7 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SRGAP1Q7Z6B7 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SRGAP1Q7Z6B7 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SRGAP1Q7Z6B7 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SRGAP1Q7Z6B7 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SRGAP1Q7Z6B7 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SRGAP1Q7Z6B7 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SRGAP1Q7Z6B7 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SRGAP1Q7Z6B7 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SRGAP1Q7Z6B7 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SRGAP1Q7Z6B7 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SRGAP1Q7Z6B7 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SRGAP1Q7Z6B7 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SRGAP1Q7Z6B7 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SRGAP1Q7Z6B7 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SRGAP1Q7Z6B7 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SRGAP1Q7Z6B7 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SRGAP1Q7Z6B7 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SRGAP1Q7Z6B7 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SRGAP1Q7Z6B7 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SRGAP1Q7Z6B7 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SRGAP1Q7Z6B7 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SRGAP1Q7Z6B7 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SRGAP1Q7Z6B7 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SRGAP1Q7Z6B7 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SRGAP1Q7Z6B7 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SRGAP1Q7Z6B7 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SRGAP1Q7Z6B7 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SRGAP1Q7Z6B7 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
SRGAP1Q7Z6B7 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
SRGAP1Q7Z6B7 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
SRGAP1Q7Z6B7 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SRGAP1Q7Z6B7 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SRGAP1Q7Z6B7 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SRGAP1Q7Z6B7 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SRGAP1Q7Z6B7 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SRGAP1Q7Z6B7 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SRGAP1Q7Z6B7 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SRGAP1Q7Z6B7 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SRGAP1Q7Z6B7 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SRGAP1Q7Z6B7 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SRGAP1Q7Z6B7 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SRGAP1Q7Z6B7 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SRGAP1Q7Z6B7 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SRGAP1Q7Z6B7 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SRGAP1Q7Z6B7 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SRGAP1Q7Z6B7 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SRGAP1Q7Z6B7 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SRGAP1Q7Z6B7 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SRGAP1Q7Z6B7 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SRGAP1Q7Z6B7 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SRGAP1Q7Z6B7 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SRGAP1Q7Z6B7 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SRGAP1Q7Z6B7 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SRGAP1Q7Z6B7 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SRGAP1Q7Z6B7 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SRGAP1Q7Z6B7 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SRGAP1Q7Z6B7 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SRGAP1Q7Z6B7 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SRGAP1Q7Z6B7 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SRGAP1Q7Z6B7 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SRGAP1Q7Z6B7 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SRGAP1Q7Z6B7 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SRGAP1Q7Z6B7 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SRGAP1Q7Z6B7 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SRGAP1Q7Z6B7 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SRGAP1Q7Z6B7 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms