Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW61

BBS12, Bardet-Biedl syndrome 12 protein, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS12Q6ZW61 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BBS12Q6ZW61 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BBS12Q6ZW61 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BBS12Q6ZW61 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BBS12Q6ZW61 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BBS12Q6ZW61 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BBS12Q6ZW61 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BBS12Q6ZW61 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BBS12Q6ZW61 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BBS12Q6ZW61 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BBS12Q6ZW61 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BBS12Q6ZW61 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BBS12Q6ZW61 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BBS12Q6ZW61 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BBS12Q6ZW61 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BBS12Q6ZW61 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BBS12Q6ZW61 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BBS12Q6ZW61 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BBS12Q6ZW61 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BBS12Q6ZW61 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BBS12Q6ZW61 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BBS12Q6ZW61 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BBS12Q6ZW61 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BBS12Q6ZW61 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BBS12Q6ZW61 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BBS12Q6ZW61 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BBS12Q6ZW61 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BBS12Q6ZW61 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BBS12Q6ZW61 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BBS12Q6ZW61 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BBS12Q6ZW61 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BBS12Q6ZW61 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BBS12Q6ZW61 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BBS12Q6ZW61 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BBS12Q6ZW61 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BBS12Q6ZW61 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BBS12Q6ZW61 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BBS12Q6ZW61 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BBS12Q6ZW61 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BBS12Q6ZW61 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BBS12Q6ZW61 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BBS12Q6ZW61 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BBS12Q6ZW61 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BBS12Q6ZW61 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BBS12Q6ZW61 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BBS12Q6ZW61 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BBS12Q6ZW61 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
BBS12Q6ZW61 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BBS12Q6ZW61 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BBS12Q6ZW61 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BBS12Q6ZW61 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BBS12Q6ZW61 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BBS12Q6ZW61 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BBS12Q6ZW61 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BBS12Q6ZW61 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BBS12Q6ZW61 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BBS12Q6ZW61 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BBS12Q6ZW61 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BBS12Q6ZW61 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BBS12Q6ZW61 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BBS12Q6ZW61 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BBS12Q6ZW61 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
BBS12Q6ZW61 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BBS12Q6ZW61 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
BBS12Q6ZW61 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BBS12Q6ZW61 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BBS12Q6ZW61 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BBS12Q6ZW61 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BBS12Q6ZW61 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BBS12Q6ZW61 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
BBS12Q6ZW61 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BBS12Q6ZW61 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BBS12Q6ZW61 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BBS12Q6ZW61 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BBS12Q6ZW61 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BBS12Q6ZW61 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BBS12Q6ZW61 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
BBS12Q6ZW61 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BBS12Q6ZW61 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BBS12Q6ZW61 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
BBS12Q6ZW61 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BBS12Q6ZW61 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BBS12Q6ZW61 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BBS12Q6ZW61 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BBS12Q6ZW61 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BBS12Q6ZW61 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BBS12Q6ZW61 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BBS12Q6ZW61 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BBS12Q6ZW61 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BBS12Q6ZW61 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BBS12Q6ZW61 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BBS12Q6ZW61 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BBS12Q6ZW61 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
BBS12Q6ZW61 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BBS12Q6ZW61 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BBS12Q6ZW61 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BBS12Q6ZW61 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BBS12Q6ZW61 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BBS12Q6ZW61 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BBS12Q6ZW61 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms