Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZTR5

CFAP47, Cilia- and flagella-associated protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 3,102 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP47Q6ZTR5 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CFAP47Q6ZTR5 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CFAP47Q6ZTR5 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CFAP47Q6ZTR5 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CFAP47Q6ZTR5 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CFAP47Q6ZTR5 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CFAP47Q6ZTR5 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CFAP47Q6ZTR5 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CFAP47Q6ZTR5 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CFAP47Q6ZTR5 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CFAP47Q6ZTR5 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CFAP47Q6ZTR5 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CFAP47Q6ZTR5 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CFAP47Q6ZTR5 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CFAP47Q6ZTR5 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CFAP47Q6ZTR5 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CFAP47Q6ZTR5 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CFAP47Q6ZTR5 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CFAP47Q6ZTR5 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CFAP47Q6ZTR5 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CFAP47Q6ZTR5 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CFAP47Q6ZTR5 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CFAP47Q6ZTR5 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CFAP47Q6ZTR5 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CFAP47Q6ZTR5 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CFAP47Q6ZTR5 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CFAP47Q6ZTR5 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CFAP47Q6ZTR5 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CFAP47Q6ZTR5 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CFAP47Q6ZTR5 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CFAP47Q6ZTR5 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CFAP47Q6ZTR5 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CFAP47Q6ZTR5 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CFAP47Q6ZTR5 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CFAP47Q6ZTR5 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CFAP47Q6ZTR5 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CFAP47Q6ZTR5 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CFAP47Q6ZTR5 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CFAP47Q6ZTR5 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CFAP47Q6ZTR5 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CFAP47Q6ZTR5 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CFAP47Q6ZTR5 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
CFAP47Q6ZTR5 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CFAP47Q6ZTR5 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CFAP47Q6ZTR5 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CFAP47Q6ZTR5 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CFAP47Q6ZTR5 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CFAP47Q6ZTR5 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CFAP47Q6ZTR5 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CFAP47Q6ZTR5 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CFAP47Q6ZTR5 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CFAP47Q6ZTR5 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CFAP47Q6ZTR5 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CFAP47Q6ZTR5 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CFAP47Q6ZTR5 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
CFAP47Q6ZTR5 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
CFAP47Q6ZTR5 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CFAP47Q6ZTR5 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CFAP47Q6ZTR5 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CFAP47Q6ZTR5 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
CFAP47Q6ZTR5 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CFAP47Q6ZTR5 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CFAP47Q6ZTR5 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CFAP47Q6ZTR5 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CFAP47Q6ZTR5 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CFAP47Q6ZTR5 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CFAP47Q6ZTR5 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CFAP47Q6ZTR5 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
CFAP47Q6ZTR5 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CFAP47Q6ZTR5 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CFAP47Q6ZTR5 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CFAP47Q6ZTR5 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CFAP47Q6ZTR5 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
CFAP47Q6ZTR5 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CFAP47Q6ZTR5 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CFAP47Q6ZTR5 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CFAP47Q6ZTR5 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CFAP47Q6ZTR5 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CFAP47Q6ZTR5 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CFAP47Q6ZTR5 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CFAP47Q6ZTR5 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CFAP47Q6ZTR5 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CFAP47Q6ZTR5 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
CFAP47Q6ZTR5 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CFAP47Q6ZTR5 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CFAP47Q6ZTR5 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CFAP47Q6ZTR5 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CFAP47Q6ZTR5 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CFAP47Q6ZTR5 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CFAP47Q6ZTR5 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CFAP47Q6ZTR5 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CFAP47Q6ZTR5 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CFAP47Q6ZTR5 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CFAP47Q6ZTR5 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CFAP47Q6ZTR5 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CFAP47Q6ZTR5 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CFAP47Q6ZTR5 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CFAP47Q6ZTR5 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CFAP47Q6ZTR5 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CFAP47Q6ZTR5 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
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