Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZTI6

RFLNA, Refilin-A, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFLNAQ6ZTI6 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RFLNAQ6ZTI6 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RFLNAQ6ZTI6 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RFLNAQ6ZTI6 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RFLNAQ6ZTI6 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RFLNAQ6ZTI6 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RFLNAQ6ZTI6 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RFLNAQ6ZTI6 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RFLNAQ6ZTI6 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RFLNAQ6ZTI6 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RFLNAQ6ZTI6 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RFLNAQ6ZTI6 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RFLNAQ6ZTI6 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RFLNAQ6ZTI6 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RFLNAQ6ZTI6 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RFLNAQ6ZTI6 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RFLNAQ6ZTI6 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RFLNAQ6ZTI6 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RFLNAQ6ZTI6 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RFLNAQ6ZTI6 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RFLNAQ6ZTI6 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RFLNAQ6ZTI6 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RFLNAQ6ZTI6 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RFLNAQ6ZTI6 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RFLNAQ6ZTI6 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RFLNAQ6ZTI6 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RFLNAQ6ZTI6 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RFLNAQ6ZTI6 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RFLNAQ6ZTI6 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RFLNAQ6ZTI6 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RFLNAQ6ZTI6 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RFLNAQ6ZTI6 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RFLNAQ6ZTI6 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RFLNAQ6ZTI6 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RFLNAQ6ZTI6 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RFLNAQ6ZTI6 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RFLNAQ6ZTI6 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RFLNAQ6ZTI6 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RFLNAQ6ZTI6 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RFLNAQ6ZTI6 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RFLNAQ6ZTI6 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RFLNAQ6ZTI6 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RFLNAQ6ZTI6 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RFLNAQ6ZTI6 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RFLNAQ6ZTI6 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RFLNAQ6ZTI6 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RFLNAQ6ZTI6 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RFLNAQ6ZTI6 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RFLNAQ6ZTI6 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RFLNAQ6ZTI6 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RFLNAQ6ZTI6 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RFLNAQ6ZTI6 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RFLNAQ6ZTI6 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RFLNAQ6ZTI6 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RFLNAQ6ZTI6 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RFLNAQ6ZTI6 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RFLNAQ6ZTI6 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RFLNAQ6ZTI6 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RFLNAQ6ZTI6 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RFLNAQ6ZTI6 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RFLNAQ6ZTI6 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RFLNAQ6ZTI6 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RFLNAQ6ZTI6 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RFLNAQ6ZTI6 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RFLNAQ6ZTI6 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RFLNAQ6ZTI6 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RFLNAQ6ZTI6 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RFLNAQ6ZTI6 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RFLNAQ6ZTI6 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RFLNAQ6ZTI6 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RFLNAQ6ZTI6 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RFLNAQ6ZTI6 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RFLNAQ6ZTI6 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RFLNAQ6ZTI6 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RFLNAQ6ZTI6 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RFLNAQ6ZTI6 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RFLNAQ6ZTI6 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RFLNAQ6ZTI6 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RFLNAQ6ZTI6 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RFLNAQ6ZTI6 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RFLNAQ6ZTI6 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RFLNAQ6ZTI6 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RFLNAQ6ZTI6 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RFLNAQ6ZTI6 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RFLNAQ6ZTI6 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RFLNAQ6ZTI6 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RFLNAQ6ZTI6 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RFLNAQ6ZTI6 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RFLNAQ6ZTI6 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RFLNAQ6ZTI6 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RFLNAQ6ZTI6 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RFLNAQ6ZTI6 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RFLNAQ6ZTI6 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RFLNAQ6ZTI6 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RFLNAQ6ZTI6 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RFLNAQ6ZTI6 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RFLNAQ6ZTI6 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RFLNAQ6ZTI6 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RFLNAQ6ZTI6 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RFLNAQ6ZTI6 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms