Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRK6

CCDC73, Coiled-coil domain-containing protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC73Q6ZRK6 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC73Q6ZRK6 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC73Q6ZRK6 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC73Q6ZRK6 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC73Q6ZRK6 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC73Q6ZRK6 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC73Q6ZRK6 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC73Q6ZRK6 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC73Q6ZRK6 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC73Q6ZRK6 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC73Q6ZRK6 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC73Q6ZRK6 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC73Q6ZRK6 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC73Q6ZRK6 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC73Q6ZRK6 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC73Q6ZRK6 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC73Q6ZRK6 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC73Q6ZRK6 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC73Q6ZRK6 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC73Q6ZRK6 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC73Q6ZRK6 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC73Q6ZRK6 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC73Q6ZRK6 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC73Q6ZRK6 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC73Q6ZRK6 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC73Q6ZRK6 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC73Q6ZRK6 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC73Q6ZRK6 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC73Q6ZRK6 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC73Q6ZRK6 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC73Q6ZRK6 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC73Q6ZRK6 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC73Q6ZRK6 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC73Q6ZRK6 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC73Q6ZRK6 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC73Q6ZRK6 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC73Q6ZRK6 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC73Q6ZRK6 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC73Q6ZRK6 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC73Q6ZRK6 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC73Q6ZRK6 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC73Q6ZRK6 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC73Q6ZRK6 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC73Q6ZRK6 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC73Q6ZRK6 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC73Q6ZRK6 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CCDC73Q6ZRK6 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC73Q6ZRK6 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC73Q6ZRK6 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC73Q6ZRK6 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC73Q6ZRK6 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC73Q6ZRK6 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC73Q6ZRK6 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC73Q6ZRK6 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC73Q6ZRK6 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC73Q6ZRK6 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC73Q6ZRK6 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC73Q6ZRK6 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC73Q6ZRK6 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC73Q6ZRK6 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC73Q6ZRK6 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC73Q6ZRK6 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC73Q6ZRK6 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC73Q6ZRK6 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC73Q6ZRK6 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC73Q6ZRK6 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC73Q6ZRK6 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC73Q6ZRK6 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC73Q6ZRK6 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC73Q6ZRK6 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC73Q6ZRK6 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC73Q6ZRK6 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC73Q6ZRK6 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC73Q6ZRK6 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC73Q6ZRK6 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC73Q6ZRK6 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC73Q6ZRK6 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC73Q6ZRK6 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC73Q6ZRK6 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC73Q6ZRK6 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC73Q6ZRK6 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC73Q6ZRK6 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC73Q6ZRK6 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC73Q6ZRK6 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC73Q6ZRK6 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC73Q6ZRK6 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC73Q6ZRK6 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC73Q6ZRK6 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC73Q6ZRK6 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC73Q6ZRK6 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC73Q6ZRK6 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC73Q6ZRK6 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC73Q6ZRK6 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC73Q6ZRK6 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC73Q6ZRK6 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC73Q6ZRK6 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC73Q6ZRK6 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC73Q6ZRK6 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC73Q6ZRK6 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CCDC73Q6ZRK6 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms