Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3R8

NEK5, Serine/threonine-protein kinase Nek5, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK5Q6P3R8 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEK5Q6P3R8 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEK5Q6P3R8 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEK5Q6P3R8 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEK5Q6P3R8 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEK5Q6P3R8 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEK5Q6P3R8 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEK5Q6P3R8 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEK5Q6P3R8 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEK5Q6P3R8 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEK5Q6P3R8 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEK5Q6P3R8 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEK5Q6P3R8 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEK5Q6P3R8 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEK5Q6P3R8 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEK5Q6P3R8 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
NEK5Q6P3R8 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NEK5Q6P3R8 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NEK5Q6P3R8 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NEK5Q6P3R8 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEK5Q6P3R8 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEK5Q6P3R8 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEK5Q6P3R8 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEK5Q6P3R8 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEK5Q6P3R8 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEK5Q6P3R8 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEK5Q6P3R8 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEK5Q6P3R8 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
NEK5Q6P3R8 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEK5Q6P3R8 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEK5Q6P3R8 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEK5Q6P3R8 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEK5Q6P3R8 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEK5Q6P3R8 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEK5Q6P3R8 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEK5Q6P3R8 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEK5Q6P3R8 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEK5Q6P3R8 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEK5Q6P3R8 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEK5Q6P3R8 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEK5Q6P3R8 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEK5Q6P3R8 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEK5Q6P3R8 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
NEK5Q6P3R8 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEK5Q6P3R8 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
NEK5Q6P3R8 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
NEK5Q6P3R8 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEK5Q6P3R8 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEK5Q6P3R8 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEK5Q6P3R8 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEK5Q6P3R8 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEK5Q6P3R8 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEK5Q6P3R8 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEK5Q6P3R8 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEK5Q6P3R8 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEK5Q6P3R8 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
NEK5Q6P3R8 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEK5Q6P3R8 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEK5Q6P3R8 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEK5Q6P3R8 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEK5Q6P3R8 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEK5Q6P3R8 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
NEK5Q6P3R8 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEK5Q6P3R8 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEK5Q6P3R8 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEK5Q6P3R8 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
NEK5Q6P3R8 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEK5Q6P3R8 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NEK5Q6P3R8 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NEK5Q6P3R8 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NEK5Q6P3R8 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NEK5Q6P3R8 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NEK5Q6P3R8 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NEK5Q6P3R8 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NEK5Q6P3R8 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NEK5Q6P3R8 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NEK5Q6P3R8 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NEK5Q6P3R8 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NEK5Q6P3R8 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
NEK5Q6P3R8 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NEK5Q6P3R8 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
NEK5Q6P3R8 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
NEK5Q6P3R8 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NEK5Q6P3R8 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NEK5Q6P3R8 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NEK5Q6P3R8 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
NEK5Q6P3R8 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
NEK5Q6P3R8 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEK5Q6P3R8 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEK5Q6P3R8 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEK5Q6P3R8 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEK5Q6P3R8 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEK5Q6P3R8 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
NEK5Q6P3R8 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEK5Q6P3R8 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEK5Q6P3R8 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEK5Q6P3R8 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEK5Q6P3R8 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
NEK5Q6P3R8 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEK5Q6P3R8 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms