Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2S7

TTC41P, Putative tetratricopeptide repeat protein 41, humanhuman

Predictions only

Length 1,318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC41PQ6P2S7 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
TTC41PQ6P2S7 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TTC41PQ6P2S7 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TTC41PQ6P2S7 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
TTC41PQ6P2S7 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TTC41PQ6P2S7 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TTC41PQ6P2S7 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TTC41PQ6P2S7 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TTC41PQ6P2S7 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TTC41PQ6P2S7 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TTC41PQ6P2S7 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TTC41PQ6P2S7 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TTC41PQ6P2S7 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TTC41PQ6P2S7 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TTC41PQ6P2S7 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TTC41PQ6P2S7 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TTC41PQ6P2S7 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TTC41PQ6P2S7 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TTC41PQ6P2S7 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
TTC41PQ6P2S7 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
TTC41PQ6P2S7 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
TTC41PQ6P2S7 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
TTC41PQ6P2S7 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
TTC41PQ6P2S7 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TTC41PQ6P2S7 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TTC41PQ6P2S7 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TTC41PQ6P2S7 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TTC41PQ6P2S7 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TTC41PQ6P2S7 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TTC41PQ6P2S7 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TTC41PQ6P2S7 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TTC41PQ6P2S7 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TTC41PQ6P2S7 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TTC41PQ6P2S7 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TTC41PQ6P2S7 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TTC41PQ6P2S7 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TTC41PQ6P2S7 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TTC41PQ6P2S7 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TTC41PQ6P2S7 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TTC41PQ6P2S7 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TTC41PQ6P2S7 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TTC41PQ6P2S7 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TTC41PQ6P2S7 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TTC41PQ6P2S7 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TTC41PQ6P2S7 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TTC41PQ6P2S7 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TTC41PQ6P2S7 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TTC41PQ6P2S7 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TTC41PQ6P2S7 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TTC41PQ6P2S7 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TTC41PQ6P2S7 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TTC41PQ6P2S7 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TTC41PQ6P2S7 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TTC41PQ6P2S7 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TTC41PQ6P2S7 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TTC41PQ6P2S7 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TTC41PQ6P2S7 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TTC41PQ6P2S7 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TTC41PQ6P2S7 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
TTC41PQ6P2S7 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TTC41PQ6P2S7 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TTC41PQ6P2S7 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TTC41PQ6P2S7 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
TTC41PQ6P2S7 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TTC41PQ6P2S7 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TTC41PQ6P2S7 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TTC41PQ6P2S7 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TTC41PQ6P2S7 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TTC41PQ6P2S7 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TTC41PQ6P2S7 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TTC41PQ6P2S7 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TTC41PQ6P2S7 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
TTC41PQ6P2S7 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TTC41PQ6P2S7 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TTC41PQ6P2S7 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TTC41PQ6P2S7 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TTC41PQ6P2S7 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TTC41PQ6P2S7 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TTC41PQ6P2S7 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
TTC41PQ6P2S7 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
TTC41PQ6P2S7 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.97
TTC41PQ6P2S7 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
TTC41PQ6P2S7 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
TTC41PQ6P2S7 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TTC41PQ6P2S7 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TTC41PQ6P2S7 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TTC41PQ6P2S7 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TTC41PQ6P2S7 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TTC41PQ6P2S7 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TTC41PQ6P2S7 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TTC41PQ6P2S7 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TTC41PQ6P2S7 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TTC41PQ6P2S7 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TTC41PQ6P2S7 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TTC41PQ6P2S7 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TTC41PQ6P2S7 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TTC41PQ6P2S7 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TTC41PQ6P2S7 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TTC41PQ6P2S7 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TTC41PQ6P2S7 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms