Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZY7

CDC42EP5, Cdc42 effector protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP5Q6NZY7 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CDC42EP5Q6NZY7 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CDC42EP5Q6NZY7 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CDC42EP5Q6NZY7 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CDC42EP5Q6NZY7 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CDC42EP5Q6NZY7 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CDC42EP5Q6NZY7 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CDC42EP5Q6NZY7 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CDC42EP5Q6NZY7 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CDC42EP5Q6NZY7 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CDC42EP5Q6NZY7 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CDC42EP5Q6NZY7 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CDC42EP5Q6NZY7 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CDC42EP5Q6NZY7 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CDC42EP5Q6NZY7 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CDC42EP5Q6NZY7 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CDC42EP5Q6NZY7 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CDC42EP5Q6NZY7 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CDC42EP5Q6NZY7 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CDC42EP5Q6NZY7 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CDC42EP5Q6NZY7 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CDC42EP5Q6NZY7 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CDC42EP5Q6NZY7 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CDC42EP5Q6NZY7 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CDC42EP5Q6NZY7 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CDC42EP5Q6NZY7 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CDC42EP5Q6NZY7 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CDC42EP5Q6NZY7 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CDC42EP5Q6NZY7 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CDC42EP5Q6NZY7 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CDC42EP5Q6NZY7 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CDC42EP5Q6NZY7 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CDC42EP5Q6NZY7 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CDC42EP5Q6NZY7 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CDC42EP5Q6NZY7 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CDC42EP5Q6NZY7 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CDC42EP5Q6NZY7 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CDC42EP5Q6NZY7 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
CDC42EP5Q6NZY7 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CDC42EP5Q6NZY7 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CDC42EP5Q6NZY7 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
CDC42EP5Q6NZY7 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CDC42EP5Q6NZY7 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CDC42EP5Q6NZY7 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CDC42EP5Q6NZY7 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CDC42EP5Q6NZY7 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CDC42EP5Q6NZY7 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CDC42EP5Q6NZY7 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CDC42EP5Q6NZY7 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CDC42EP5Q6NZY7 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CDC42EP5Q6NZY7 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CDC42EP5Q6NZY7 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
CDC42EP5Q6NZY7 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CDC42EP5Q6NZY7 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CDC42EP5Q6NZY7 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CDC42EP5Q6NZY7 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CDC42EP5Q6NZY7 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CDC42EP5Q6NZY7 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CDC42EP5Q6NZY7 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CDC42EP5Q6NZY7 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CDC42EP5Q6NZY7 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CDC42EP5Q6NZY7 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CDC42EP5Q6NZY7 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CDC42EP5Q6NZY7 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CDC42EP5Q6NZY7 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CDC42EP5Q6NZY7 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CDC42EP5Q6NZY7 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CDC42EP5Q6NZY7 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CDC42EP5Q6NZY7 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CDC42EP5Q6NZY7 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CDC42EP5Q6NZY7 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CDC42EP5Q6NZY7 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CDC42EP5Q6NZY7 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CDC42EP5Q6NZY7 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CDC42EP5Q6NZY7 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CDC42EP5Q6NZY7 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CDC42EP5Q6NZY7 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CDC42EP5Q6NZY7 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CDC42EP5Q6NZY7 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CDC42EP5Q6NZY7 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CDC42EP5Q6NZY7 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CDC42EP5Q6NZY7 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CDC42EP5Q6NZY7 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CDC42EP5Q6NZY7 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CDC42EP5Q6NZY7 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CDC42EP5Q6NZY7 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CDC42EP5Q6NZY7 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CDC42EP5Q6NZY7 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CDC42EP5Q6NZY7 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CDC42EP5Q6NZY7 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CDC42EP5Q6NZY7 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CDC42EP5Q6NZY7 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CDC42EP5Q6NZY7 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CDC42EP5Q6NZY7 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CDC42EP5Q6NZY7 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CDC42EP5Q6NZY7 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CDC42EP5Q6NZY7 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CDC42EP5Q6NZY7 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CDC42EP5Q6NZY7 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CDC42EP5Q6NZY7 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms