Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZY4

ZCCHC8, Zinc finger CCHC domain-containing protein 8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 707 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC8Q6NZY4 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZCCHC8Q6NZY4 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZCCHC8Q6NZY4 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZCCHC8Q6NZY4 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZCCHC8Q6NZY4 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZCCHC8Q6NZY4 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZCCHC8Q6NZY4 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZCCHC8Q6NZY4 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZCCHC8Q6NZY4 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZCCHC8Q6NZY4 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ZCCHC8Q6NZY4 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ZCCHC8Q6NZY4 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZCCHC8Q6NZY4 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ZCCHC8Q6NZY4 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZCCHC8Q6NZY4 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZCCHC8Q6NZY4 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZCCHC8Q6NZY4 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZCCHC8Q6NZY4 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ZCCHC8Q6NZY4 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ZCCHC8Q6NZY4 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZCCHC8Q6NZY4 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZCCHC8Q6NZY4 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZCCHC8Q6NZY4 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZCCHC8Q6NZY4 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZCCHC8Q6NZY4 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZCCHC8Q6NZY4 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZCCHC8Q6NZY4 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZCCHC8Q6NZY4 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZCCHC8Q6NZY4 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ZCCHC8Q6NZY4 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ZCCHC8Q6NZY4 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ZCCHC8Q6NZY4 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZCCHC8Q6NZY4 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZCCHC8Q6NZY4 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZCCHC8Q6NZY4 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZCCHC8Q6NZY4 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZCCHC8Q6NZY4 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZCCHC8Q6NZY4 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZCCHC8Q6NZY4 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZCCHC8Q6NZY4 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZCCHC8Q6NZY4 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZCCHC8Q6NZY4 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZCCHC8Q6NZY4 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZCCHC8Q6NZY4 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZCCHC8Q6NZY4 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZCCHC8Q6NZY4 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZCCHC8Q6NZY4 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZCCHC8Q6NZY4 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZCCHC8Q6NZY4 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZCCHC8Q6NZY4 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ZCCHC8Q6NZY4 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ZCCHC8Q6NZY4 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ZCCHC8Q6NZY4 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZCCHC8Q6NZY4 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZCCHC8Q6NZY4 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZCCHC8Q6NZY4 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZCCHC8Q6NZY4 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZCCHC8Q6NZY4 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZCCHC8Q6NZY4 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZCCHC8Q6NZY4 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZCCHC8Q6NZY4 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZCCHC8Q6NZY4 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZCCHC8Q6NZY4 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZCCHC8Q6NZY4 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ZCCHC8Q6NZY4 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZCCHC8Q6NZY4 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZCCHC8Q6NZY4 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZCCHC8Q6NZY4 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ZCCHC8Q6NZY4 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ZCCHC8Q6NZY4 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ZCCHC8Q6NZY4 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ZCCHC8Q6NZY4 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ZCCHC8Q6NZY4 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ZCCHC8Q6NZY4 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZCCHC8Q6NZY4 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZCCHC8Q6NZY4 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZCCHC8Q6NZY4 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZCCHC8Q6NZY4 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZCCHC8Q6NZY4 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZCCHC8Q6NZY4 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ZCCHC8Q6NZY4 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZCCHC8Q6NZY4 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZCCHC8Q6NZY4 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZCCHC8Q6NZY4 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZCCHC8Q6NZY4 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZCCHC8Q6NZY4 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZCCHC8Q6NZY4 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZCCHC8Q6NZY4 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZCCHC8Q6NZY4 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZCCHC8Q6NZY4 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZCCHC8Q6NZY4 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZCCHC8Q6NZY4 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZCCHC8Q6NZY4 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZCCHC8Q6NZY4 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZCCHC8Q6NZY4 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZCCHC8Q6NZY4 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZCCHC8Q6NZY4 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZCCHC8Q6NZY4 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZCCHC8Q6NZY4 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZCCHC8Q6NZY4 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms