Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXR0

IRGC, Interferon-inducible GTPase 5, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRGCQ6NXR0 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
IRGCQ6NXR0 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
IRGCQ6NXR0 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IRGCQ6NXR0 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IRGCQ6NXR0 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IRGCQ6NXR0 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
IRGCQ6NXR0 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
IRGCQ6NXR0 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
IRGCQ6NXR0 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
IRGCQ6NXR0 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
IRGCQ6NXR0 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IRGCQ6NXR0 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
IRGCQ6NXR0 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
IRGCQ6NXR0 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IRGCQ6NXR0 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IRGCQ6NXR0 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IRGCQ6NXR0 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IRGCQ6NXR0 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IRGCQ6NXR0 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IRGCQ6NXR0 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IRGCQ6NXR0 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IRGCQ6NXR0 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IRGCQ6NXR0 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
IRGCQ6NXR0 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IRGCQ6NXR0 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IRGCQ6NXR0 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IRGCQ6NXR0 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IRGCQ6NXR0 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IRGCQ6NXR0 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IRGCQ6NXR0 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IRGCQ6NXR0 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IRGCQ6NXR0 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IRGCQ6NXR0 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IRGCQ6NXR0 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IRGCQ6NXR0 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
IRGCQ6NXR0 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IRGCQ6NXR0 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IRGCQ6NXR0 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IRGCQ6NXR0 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IRGCQ6NXR0 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IRGCQ6NXR0 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IRGCQ6NXR0 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IRGCQ6NXR0 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IRGCQ6NXR0 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IRGCQ6NXR0 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IRGCQ6NXR0 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IRGCQ6NXR0 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IRGCQ6NXR0 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IRGCQ6NXR0 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IRGCQ6NXR0 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IRGCQ6NXR0 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
IRGCQ6NXR0 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IRGCQ6NXR0 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IRGCQ6NXR0 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IRGCQ6NXR0 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IRGCQ6NXR0 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IRGCQ6NXR0 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IRGCQ6NXR0 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IRGCQ6NXR0 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IRGCQ6NXR0 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IRGCQ6NXR0 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IRGCQ6NXR0 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IRGCQ6NXR0 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IRGCQ6NXR0 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IRGCQ6NXR0 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IRGCQ6NXR0 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
IRGCQ6NXR0 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IRGCQ6NXR0 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IRGCQ6NXR0 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IRGCQ6NXR0 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IRGCQ6NXR0 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IRGCQ6NXR0 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IRGCQ6NXR0 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IRGCQ6NXR0 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IRGCQ6NXR0 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IRGCQ6NXR0 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
IRGCQ6NXR0 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
IRGCQ6NXR0 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
IRGCQ6NXR0 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IRGCQ6NXR0 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IRGCQ6NXR0 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IRGCQ6NXR0 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IRGCQ6NXR0 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IRGCQ6NXR0 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IRGCQ6NXR0 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
IRGCQ6NXR0 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IRGCQ6NXR0 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IRGCQ6NXR0 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IRGCQ6NXR0 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IRGCQ6NXR0 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IRGCQ6NXR0 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
IRGCQ6NXR0 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IRGCQ6NXR0 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IRGCQ6NXR0 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
IRGCQ6NXR0 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IRGCQ6NXR0 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IRGCQ6NXR0 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IRGCQ6NXR0 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IRGCQ6NXR0 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IRGCQ6NXR0 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms