Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT89

TRNP1, TMF-regulated nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNP1Q6NT89 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRNP1Q6NT89 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRNP1Q6NT89 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRNP1Q6NT89 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRNP1Q6NT89 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRNP1Q6NT89 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRNP1Q6NT89 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TRNP1Q6NT89 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRNP1Q6NT89 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TRNP1Q6NT89 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TRNP1Q6NT89 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRNP1Q6NT89 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRNP1Q6NT89 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRNP1Q6NT89 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRNP1Q6NT89 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRNP1Q6NT89 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TRNP1Q6NT89 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRNP1Q6NT89 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRNP1Q6NT89 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRNP1Q6NT89 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRNP1Q6NT89 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRNP1Q6NT89 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TRNP1Q6NT89 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRNP1Q6NT89 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRNP1Q6NT89 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRNP1Q6NT89 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRNP1Q6NT89 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRNP1Q6NT89 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRNP1Q6NT89 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRNP1Q6NT89 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRNP1Q6NT89 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRNP1Q6NT89 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRNP1Q6NT89 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRNP1Q6NT89 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRNP1Q6NT89 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRNP1Q6NT89 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRNP1Q6NT89 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRNP1Q6NT89 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRNP1Q6NT89 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRNP1Q6NT89 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRNP1Q6NT89 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRNP1Q6NT89 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRNP1Q6NT89 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRNP1Q6NT89 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRNP1Q6NT89 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRNP1Q6NT89 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRNP1Q6NT89 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TRNP1Q6NT89 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRNP1Q6NT89 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRNP1Q6NT89 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRNP1Q6NT89 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRNP1Q6NT89 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRNP1Q6NT89 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRNP1Q6NT89 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRNP1Q6NT89 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRNP1Q6NT89 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRNP1Q6NT89 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRNP1Q6NT89 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRNP1Q6NT89 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRNP1Q6NT89 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRNP1Q6NT89 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRNP1Q6NT89 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRNP1Q6NT89 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRNP1Q6NT89 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRNP1Q6NT89 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRNP1Q6NT89 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRNP1Q6NT89 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRNP1Q6NT89 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRNP1Q6NT89 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRNP1Q6NT89 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRNP1Q6NT89 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRNP1Q6NT89 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRNP1Q6NT89 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRNP1Q6NT89 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRNP1Q6NT89 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRNP1Q6NT89 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRNP1Q6NT89 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRNP1Q6NT89 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRNP1Q6NT89 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRNP1Q6NT89 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRNP1Q6NT89 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRNP1Q6NT89 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRNP1Q6NT89 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRNP1Q6NT89 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRNP1Q6NT89 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRNP1Q6NT89 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRNP1Q6NT89 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRNP1Q6NT89 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRNP1Q6NT89 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRNP1Q6NT89 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRNP1Q6NT89 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRNP1Q6NT89 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TRNP1Q6NT89 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TRNP1Q6NT89 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRNP1Q6NT89 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRNP1Q6NT89 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRNP1Q6NT89 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRNP1Q6NT89 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRNP1Q6NT89 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRNP1Q6NT89 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms