Protein–RNA interactions for Protein: Q69YQ0

SPECC1L, Cytospin-A, humanhuman

Predictions only

Length 1,117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPECC1LQ69YQ0 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPECC1LQ69YQ0 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SPECC1LQ69YQ0 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SPECC1LQ69YQ0 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SPECC1LQ69YQ0 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SPECC1LQ69YQ0 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SPECC1LQ69YQ0 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SPECC1LQ69YQ0 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SPECC1LQ69YQ0 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SPECC1LQ69YQ0 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SPECC1LQ69YQ0 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SPECC1LQ69YQ0 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SPECC1LQ69YQ0 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SPECC1LQ69YQ0 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SPECC1LQ69YQ0 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SPECC1LQ69YQ0 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SPECC1LQ69YQ0 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SPECC1LQ69YQ0 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
SPECC1LQ69YQ0 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SPECC1LQ69YQ0 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SPECC1LQ69YQ0 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SPECC1LQ69YQ0 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SPECC1LQ69YQ0 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SPECC1LQ69YQ0 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SPECC1LQ69YQ0 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SPECC1LQ69YQ0 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SPECC1LQ69YQ0 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SPECC1LQ69YQ0 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SPECC1LQ69YQ0 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SPECC1LQ69YQ0 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SPECC1LQ69YQ0 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SPECC1LQ69YQ0 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SPECC1LQ69YQ0 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SPECC1LQ69YQ0 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SPECC1LQ69YQ0 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPECC1LQ69YQ0 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPECC1LQ69YQ0 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPECC1LQ69YQ0 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPECC1LQ69YQ0 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPECC1LQ69YQ0 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPECC1LQ69YQ0 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPECC1LQ69YQ0 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPECC1LQ69YQ0 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SPECC1LQ69YQ0 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPECC1LQ69YQ0 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPECC1LQ69YQ0 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPECC1LQ69YQ0 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SPECC1LQ69YQ0 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SPECC1LQ69YQ0 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SPECC1LQ69YQ0 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SPECC1LQ69YQ0 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SPECC1LQ69YQ0 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SPECC1LQ69YQ0 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SPECC1LQ69YQ0 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SPECC1LQ69YQ0 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPECC1LQ69YQ0 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPECC1LQ69YQ0 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPECC1LQ69YQ0 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPECC1LQ69YQ0 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPECC1LQ69YQ0 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPECC1LQ69YQ0 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPECC1LQ69YQ0 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPECC1LQ69YQ0 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPECC1LQ69YQ0 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SPECC1LQ69YQ0 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SPECC1LQ69YQ0 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SPECC1LQ69YQ0 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SPECC1LQ69YQ0 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SPECC1LQ69YQ0 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SPECC1LQ69YQ0 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SPECC1LQ69YQ0 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SPECC1LQ69YQ0 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SPECC1LQ69YQ0 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SPECC1LQ69YQ0 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SPECC1LQ69YQ0 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SPECC1LQ69YQ0 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SPECC1LQ69YQ0 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SPECC1LQ69YQ0 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPECC1LQ69YQ0 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPECC1LQ69YQ0 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPECC1LQ69YQ0 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPECC1LQ69YQ0 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPECC1LQ69YQ0 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPECC1LQ69YQ0 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPECC1LQ69YQ0 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SPECC1LQ69YQ0 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SPECC1LQ69YQ0 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SPECC1LQ69YQ0 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SPECC1LQ69YQ0 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SPECC1LQ69YQ0 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SPECC1LQ69YQ0 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SPECC1LQ69YQ0 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPECC1LQ69YQ0 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPECC1LQ69YQ0 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPECC1LQ69YQ0 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPECC1LQ69YQ0 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPECC1LQ69YQ0 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPECC1LQ69YQ0 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPECC1LQ69YQ0 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPECC1LQ69YQ0 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms