Protein–RNA interactions for Protein: Q68DU8

KCTD16, BTB/POZ domain-containing protein KCTD16, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD16Q68DU8 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KCTD16Q68DU8 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KCTD16Q68DU8 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KCTD16Q68DU8 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KCTD16Q68DU8 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KCTD16Q68DU8 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KCTD16Q68DU8 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KCTD16Q68DU8 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
KCTD16Q68DU8 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KCTD16Q68DU8 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KCTD16Q68DU8 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KCTD16Q68DU8 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KCTD16Q68DU8 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
KCTD16Q68DU8 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KCTD16Q68DU8 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KCTD16Q68DU8 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KCTD16Q68DU8 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KCTD16Q68DU8 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KCTD16Q68DU8 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KCTD16Q68DU8 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KCTD16Q68DU8 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KCTD16Q68DU8 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KCTD16Q68DU8 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
KCTD16Q68DU8 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KCTD16Q68DU8 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KCTD16Q68DU8 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KCTD16Q68DU8 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KCTD16Q68DU8 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
KCTD16Q68DU8 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KCTD16Q68DU8 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KCTD16Q68DU8 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KCTD16Q68DU8 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KCTD16Q68DU8 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KCTD16Q68DU8 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KCTD16Q68DU8 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KCTD16Q68DU8 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KCTD16Q68DU8 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KCTD16Q68DU8 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KCTD16Q68DU8 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KCTD16Q68DU8 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KCTD16Q68DU8 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KCTD16Q68DU8 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
KCTD16Q68DU8 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
KCTD16Q68DU8 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.35
KCTD16Q68DU8 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
KCTD16Q68DU8 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KCTD16Q68DU8 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KCTD16Q68DU8 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KCTD16Q68DU8 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KCTD16Q68DU8 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KCTD16Q68DU8 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KCTD16Q68DU8 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KCTD16Q68DU8 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KCTD16Q68DU8 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KCTD16Q68DU8 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCTD16Q68DU8 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCTD16Q68DU8 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCTD16Q68DU8 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCTD16Q68DU8 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCTD16Q68DU8 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCTD16Q68DU8 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCTD16Q68DU8 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCTD16Q68DU8 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCTD16Q68DU8 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCTD16Q68DU8 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCTD16Q68DU8 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCTD16Q68DU8 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCTD16Q68DU8 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCTD16Q68DU8 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCTD16Q68DU8 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCTD16Q68DU8 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCTD16Q68DU8 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCTD16Q68DU8 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCTD16Q68DU8 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCTD16Q68DU8 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCTD16Q68DU8 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCTD16Q68DU8 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
KCTD16Q68DU8 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCTD16Q68DU8 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCTD16Q68DU8 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCTD16Q68DU8 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCTD16Q68DU8 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCTD16Q68DU8 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCTD16Q68DU8 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCTD16Q68DU8 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCTD16Q68DU8 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCTD16Q68DU8 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCTD16Q68DU8 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCTD16Q68DU8 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCTD16Q68DU8 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCTD16Q68DU8 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
KCTD16Q68DU8 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCTD16Q68DU8 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCTD16Q68DU8 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCTD16Q68DU8 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCTD16Q68DU8 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCTD16Q68DU8 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCTD16Q68DU8 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCTD16Q68DU8 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCTD16Q68DU8 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms