Protein–RNA interactions for Protein: Q68D06

SLFN13, Schlafen family member 13, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN13Q68D06 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLFN13Q68D06 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLFN13Q68D06 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLFN13Q68D06 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLFN13Q68D06 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.79
SLFN13Q68D06 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SLFN13Q68D06 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SLFN13Q68D06 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SLFN13Q68D06 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SLFN13Q68D06 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
SLFN13Q68D06 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLFN13Q68D06 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLFN13Q68D06 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLFN13Q68D06 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLFN13Q68D06 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLFN13Q68D06 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLFN13Q68D06 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLFN13Q68D06 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLFN13Q68D06 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLFN13Q68D06 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLFN13Q68D06 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLFN13Q68D06 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLFN13Q68D06 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLFN13Q68D06 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLFN13Q68D06 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLFN13Q68D06 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLFN13Q68D06 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
SLFN13Q68D06 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLFN13Q68D06 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLFN13Q68D06 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLFN13Q68D06 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLFN13Q68D06 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLFN13Q68D06 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLFN13Q68D06 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLFN13Q68D06 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLFN13Q68D06 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLFN13Q68D06 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
SLFN13Q68D06 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLFN13Q68D06 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLFN13Q68D06 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
SLFN13Q68D06 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLFN13Q68D06 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLFN13Q68D06 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
SLFN13Q68D06 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLFN13Q68D06 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLFN13Q68D06 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLFN13Q68D06 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLFN13Q68D06 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLFN13Q68D06 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLFN13Q68D06 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLFN13Q68D06 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLFN13Q68D06 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
SLFN13Q68D06 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLFN13Q68D06 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLFN13Q68D06 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLFN13Q68D06 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLFN13Q68D06 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLFN13Q68D06 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLFN13Q68D06 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLFN13Q68D06 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
SLFN13Q68D06 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLFN13Q68D06 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLFN13Q68D06 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLFN13Q68D06 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLFN13Q68D06 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SLFN13Q68D06 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SLFN13Q68D06 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLFN13Q68D06 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLFN13Q68D06 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLFN13Q68D06 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLFN13Q68D06 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLFN13Q68D06 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLFN13Q68D06 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLFN13Q68D06 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLFN13Q68D06 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLFN13Q68D06 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLFN13Q68D06 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLFN13Q68D06 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLFN13Q68D06 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLFN13Q68D06 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLFN13Q68D06 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLFN13Q68D06 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
SLFN13Q68D06 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLFN13Q68D06 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLFN13Q68D06 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLFN13Q68D06 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLFN13Q68D06 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLFN13Q68D06 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLFN13Q68D06 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLFN13Q68D06 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
SLFN13Q68D06 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLFN13Q68D06 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLFN13Q68D06 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLFN13Q68D06 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLFN13Q68D06 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLFN13Q68D06 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLFN13Q68D06 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLFN13Q68D06 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLFN13Q68D06 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLFN13Q68D06 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms