Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATG16L1Q676U5 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATG16L1Q676U5 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATG16L1Q676U5 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATG16L1Q676U5 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATG16L1Q676U5 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATG16L1Q676U5 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATG16L1Q676U5 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATG16L1Q676U5 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATG16L1Q676U5 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATG16L1Q676U5 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATG16L1Q676U5 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATG16L1Q676U5 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATG16L1Q676U5 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATG16L1Q676U5 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATG16L1Q676U5 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATG16L1Q676U5 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATG16L1Q676U5 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATG16L1Q676U5 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATG16L1Q676U5 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATG16L1Q676U5 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATG16L1Q676U5 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATG16L1Q676U5 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ATG16L1Q676U5 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATG16L1Q676U5 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATG16L1Q676U5 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATG16L1Q676U5 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATG16L1Q676U5 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATG16L1Q676U5 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATG16L1Q676U5 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATG16L1Q676U5 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATG16L1Q676U5 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATG16L1Q676U5 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATG16L1Q676U5 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATG16L1Q676U5 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATG16L1Q676U5 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATG16L1Q676U5 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATG16L1Q676U5 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATG16L1Q676U5 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATG16L1Q676U5 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATG16L1Q676U5 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATG16L1Q676U5 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATG16L1Q676U5 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATG16L1Q676U5 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATG16L1Q676U5 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATG16L1Q676U5 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATG16L1Q676U5 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATG16L1Q676U5 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATG16L1Q676U5 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATG16L1Q676U5 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATG16L1Q676U5 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATG16L1Q676U5 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATG16L1Q676U5 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATG16L1Q676U5 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATG16L1Q676U5 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATG16L1Q676U5 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ATG16L1Q676U5 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATG16L1Q676U5 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATG16L1Q676U5 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATG16L1Q676U5 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATG16L1Q676U5 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATG16L1Q676U5 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATG16L1Q676U5 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ATG16L1Q676U5 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATG16L1Q676U5 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATG16L1Q676U5 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATG16L1Q676U5 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATG16L1Q676U5 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATG16L1Q676U5 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATG16L1Q676U5 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATG16L1Q676U5 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATG16L1Q676U5 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATG16L1Q676U5 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATG16L1Q676U5 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATG16L1Q676U5 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATG16L1Q676U5 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATG16L1Q676U5 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATG16L1Q676U5 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATG16L1Q676U5 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ATG16L1Q676U5 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATG16L1Q676U5 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATG16L1Q676U5 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATG16L1Q676U5 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATG16L1Q676U5 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ATG16L1Q676U5 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATG16L1Q676U5 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATG16L1Q676U5 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATG16L1Q676U5 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATG16L1Q676U5 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATG16L1Q676U5 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATG16L1Q676U5 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATG16L1Q676U5 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATG16L1Q676U5 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATG16L1Q676U5 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATG16L1Q676U5 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATG16L1Q676U5 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATG16L1Q676U5 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATG16L1Q676U5 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATG16L1Q676U5 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATG16L1Q676U5 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms