Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYY2

LIPM, Lipase member M, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIPMQ5VYY2 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LIPMQ5VYY2 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LIPMQ5VYY2 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LIPMQ5VYY2 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LIPMQ5VYY2 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LIPMQ5VYY2 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LIPMQ5VYY2 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LIPMQ5VYY2 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
LIPMQ5VYY2 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LIPMQ5VYY2 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LIPMQ5VYY2 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LIPMQ5VYY2 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LIPMQ5VYY2 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LIPMQ5VYY2 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LIPMQ5VYY2 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LIPMQ5VYY2 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LIPMQ5VYY2 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LIPMQ5VYY2 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LIPMQ5VYY2 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
LIPMQ5VYY2 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LIPMQ5VYY2 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LIPMQ5VYY2 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LIPMQ5VYY2 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LIPMQ5VYY2 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LIPMQ5VYY2 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LIPMQ5VYY2 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LIPMQ5VYY2 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LIPMQ5VYY2 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LIPMQ5VYY2 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
LIPMQ5VYY2 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LIPMQ5VYY2 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LIPMQ5VYY2 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LIPMQ5VYY2 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LIPMQ5VYY2 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LIPMQ5VYY2 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LIPMQ5VYY2 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LIPMQ5VYY2 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LIPMQ5VYY2 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LIPMQ5VYY2 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LIPMQ5VYY2 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LIPMQ5VYY2 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LIPMQ5VYY2 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LIPMQ5VYY2 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LIPMQ5VYY2 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LIPMQ5VYY2 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LIPMQ5VYY2 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LIPMQ5VYY2 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LIPMQ5VYY2 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LIPMQ5VYY2 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LIPMQ5VYY2 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LIPMQ5VYY2 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LIPMQ5VYY2 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LIPMQ5VYY2 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LIPMQ5VYY2 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LIPMQ5VYY2 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LIPMQ5VYY2 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LIPMQ5VYY2 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LIPMQ5VYY2 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
LIPMQ5VYY2 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LIPMQ5VYY2 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LIPMQ5VYY2 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LIPMQ5VYY2 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LIPMQ5VYY2 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LIPMQ5VYY2 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LIPMQ5VYY2 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LIPMQ5VYY2 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LIPMQ5VYY2 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LIPMQ5VYY2 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LIPMQ5VYY2 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LIPMQ5VYY2 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LIPMQ5VYY2 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LIPMQ5VYY2 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LIPMQ5VYY2 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LIPMQ5VYY2 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LIPMQ5VYY2 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LIPMQ5VYY2 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LIPMQ5VYY2 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LIPMQ5VYY2 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LIPMQ5VYY2 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
LIPMQ5VYY2 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
LIPMQ5VYY2 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LIPMQ5VYY2 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LIPMQ5VYY2 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LIPMQ5VYY2 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LIPMQ5VYY2 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LIPMQ5VYY2 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LIPMQ5VYY2 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
LIPMQ5VYY2 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LIPMQ5VYY2 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LIPMQ5VYY2 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LIPMQ5VYY2 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LIPMQ5VYY2 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LIPMQ5VYY2 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LIPMQ5VYY2 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LIPMQ5VYY2 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LIPMQ5VYY2 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LIPMQ5VYY2 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
LIPMQ5VYY2 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22■■□□□ 1.11
LIPMQ5VYY2 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
LIPMQ5VYY2 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms