Protein–RNA interactions for Protein: Q5TAH2

SLC9C2, Sodium/hydrogen exchanger 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9C2Q5TAH2 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SLC9C2Q5TAH2 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SLC9C2Q5TAH2 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SLC9C2Q5TAH2 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SLC9C2Q5TAH2 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
SLC9C2Q5TAH2 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SLC9C2Q5TAH2 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SLC9C2Q5TAH2 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SLC9C2Q5TAH2 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SLC9C2Q5TAH2 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SLC9C2Q5TAH2 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SLC9C2Q5TAH2 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SLC9C2Q5TAH2 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SLC9C2Q5TAH2 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SLC9C2Q5TAH2 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
SLC9C2Q5TAH2 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SLC9C2Q5TAH2 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SLC9C2Q5TAH2 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SLC9C2Q5TAH2 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SLC9C2Q5TAH2 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SLC9C2Q5TAH2 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SLC9C2Q5TAH2 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SLC9C2Q5TAH2 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
SLC9C2Q5TAH2 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SLC9C2Q5TAH2 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SLC9C2Q5TAH2 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
SLC9C2Q5TAH2 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SLC9C2Q5TAH2 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
SLC9C2Q5TAH2 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SLC9C2Q5TAH2 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SLC9C2Q5TAH2 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SLC9C2Q5TAH2 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
SLC9C2Q5TAH2 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SLC9C2Q5TAH2 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SLC9C2Q5TAH2 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SLC9C2Q5TAH2 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SLC9C2Q5TAH2 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SLC9C2Q5TAH2 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SLC9C2Q5TAH2 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLC9C2Q5TAH2 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLC9C2Q5TAH2 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLC9C2Q5TAH2 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLC9C2Q5TAH2 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLC9C2Q5TAH2 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLC9C2Q5TAH2 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLC9C2Q5TAH2 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLC9C2Q5TAH2 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLC9C2Q5TAH2 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
SLC9C2Q5TAH2 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLC9C2Q5TAH2 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLC9C2Q5TAH2 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLC9C2Q5TAH2 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLC9C2Q5TAH2 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLC9C2Q5TAH2 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLC9C2Q5TAH2 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLC9C2Q5TAH2 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLC9C2Q5TAH2 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLC9C2Q5TAH2 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLC9C2Q5TAH2 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLC9C2Q5TAH2 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLC9C2Q5TAH2 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLC9C2Q5TAH2 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLC9C2Q5TAH2 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLC9C2Q5TAH2 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLC9C2Q5TAH2 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
SLC9C2Q5TAH2 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLC9C2Q5TAH2 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLC9C2Q5TAH2 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLC9C2Q5TAH2 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLC9C2Q5TAH2 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLC9C2Q5TAH2 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLC9C2Q5TAH2 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLC9C2Q5TAH2 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLC9C2Q5TAH2 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLC9C2Q5TAH2 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SLC9C2Q5TAH2 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SLC9C2Q5TAH2 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
SLC9C2Q5TAH2 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SLC9C2Q5TAH2 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
SLC9C2Q5TAH2 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SLC9C2Q5TAH2 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
SLC9C2Q5TAH2 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SLC9C2Q5TAH2 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SLC9C2Q5TAH2 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SLC9C2Q5TAH2 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SLC9C2Q5TAH2 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SLC9C2Q5TAH2 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SLC9C2Q5TAH2 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SLC9C2Q5TAH2 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SLC9C2Q5TAH2 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
SLC9C2Q5TAH2 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SLC9C2Q5TAH2 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SLC9C2Q5TAH2 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SLC9C2Q5TAH2 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLC9C2Q5TAH2 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLC9C2Q5TAH2 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLC9C2Q5TAH2 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLC9C2Q5TAH2 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
SLC9C2Q5TAH2 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
SLC9C2Q5TAH2 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.6 ms