Protein–RNA interactions for Protein: Q5T9A4

ATAD3B, ATPase family AAA domain-containing protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 648 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3BQ5T9A4 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATAD3BQ5T9A4 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATAD3BQ5T9A4 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATAD3BQ5T9A4 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATAD3BQ5T9A4 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATAD3BQ5T9A4 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATAD3BQ5T9A4 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATAD3BQ5T9A4 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATAD3BQ5T9A4 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATAD3BQ5T9A4 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATAD3BQ5T9A4 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATAD3BQ5T9A4 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ATAD3BQ5T9A4 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATAD3BQ5T9A4 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATAD3BQ5T9A4 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATAD3BQ5T9A4 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATAD3BQ5T9A4 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATAD3BQ5T9A4 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATAD3BQ5T9A4 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATAD3BQ5T9A4 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATAD3BQ5T9A4 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATAD3BQ5T9A4 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATAD3BQ5T9A4 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATAD3BQ5T9A4 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATAD3BQ5T9A4 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATAD3BQ5T9A4 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATAD3BQ5T9A4 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATAD3BQ5T9A4 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATAD3BQ5T9A4 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATAD3BQ5T9A4 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATAD3BQ5T9A4 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATAD3BQ5T9A4 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATAD3BQ5T9A4 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATAD3BQ5T9A4 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATAD3BQ5T9A4 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATAD3BQ5T9A4 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATAD3BQ5T9A4 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATAD3BQ5T9A4 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATAD3BQ5T9A4 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATAD3BQ5T9A4 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATAD3BQ5T9A4 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATAD3BQ5T9A4 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATAD3BQ5T9A4 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATAD3BQ5T9A4 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATAD3BQ5T9A4 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATAD3BQ5T9A4 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATAD3BQ5T9A4 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATAD3BQ5T9A4 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATAD3BQ5T9A4 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ATAD3BQ5T9A4 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATAD3BQ5T9A4 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATAD3BQ5T9A4 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATAD3BQ5T9A4 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATAD3BQ5T9A4 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATAD3BQ5T9A4 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATAD3BQ5T9A4 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATAD3BQ5T9A4 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATAD3BQ5T9A4 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATAD3BQ5T9A4 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATAD3BQ5T9A4 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATAD3BQ5T9A4 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATAD3BQ5T9A4 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATAD3BQ5T9A4 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATAD3BQ5T9A4 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATAD3BQ5T9A4 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATAD3BQ5T9A4 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATAD3BQ5T9A4 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATAD3BQ5T9A4 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATAD3BQ5T9A4 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATAD3BQ5T9A4 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATAD3BQ5T9A4 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATAD3BQ5T9A4 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATAD3BQ5T9A4 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATAD3BQ5T9A4 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATAD3BQ5T9A4 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ATAD3BQ5T9A4 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ATAD3BQ5T9A4 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ATAD3BQ5T9A4 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ATAD3BQ5T9A4 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATAD3BQ5T9A4 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATAD3BQ5T9A4 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATAD3BQ5T9A4 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ATAD3BQ5T9A4 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATAD3BQ5T9A4 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATAD3BQ5T9A4 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATAD3BQ5T9A4 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATAD3BQ5T9A4 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATAD3BQ5T9A4 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATAD3BQ5T9A4 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATAD3BQ5T9A4 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATAD3BQ5T9A4 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATAD3BQ5T9A4 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATAD3BQ5T9A4 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATAD3BQ5T9A4 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATAD3BQ5T9A4 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATAD3BQ5T9A4 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATAD3BQ5T9A4 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATAD3BQ5T9A4 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATAD3BQ5T9A4 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATAD3BQ5T9A4 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms