Protein–RNA interactions for Protein: Q5T7N2

L1TD1, LINE-1 type transposase domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 865 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1TD1Q5T7N2 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
L1TD1Q5T7N2 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
L1TD1Q5T7N2 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
L1TD1Q5T7N2 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.82
L1TD1Q5T7N2 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
L1TD1Q5T7N2 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
L1TD1Q5T7N2 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
L1TD1Q5T7N2 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
L1TD1Q5T7N2 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
L1TD1Q5T7N2 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
L1TD1Q5T7N2 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
L1TD1Q5T7N2 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
L1TD1Q5T7N2 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
L1TD1Q5T7N2 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
L1TD1Q5T7N2 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
L1TD1Q5T7N2 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
L1TD1Q5T7N2 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
L1TD1Q5T7N2 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
L1TD1Q5T7N2 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
L1TD1Q5T7N2 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
L1TD1Q5T7N2 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
L1TD1Q5T7N2 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
L1TD1Q5T7N2 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
L1TD1Q5T7N2 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
L1TD1Q5T7N2 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
L1TD1Q5T7N2 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
L1TD1Q5T7N2 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
L1TD1Q5T7N2 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
L1TD1Q5T7N2 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
L1TD1Q5T7N2 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
L1TD1Q5T7N2 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
L1TD1Q5T7N2 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
L1TD1Q5T7N2 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
L1TD1Q5T7N2 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
L1TD1Q5T7N2 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
L1TD1Q5T7N2 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
L1TD1Q5T7N2 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
L1TD1Q5T7N2 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
L1TD1Q5T7N2 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
L1TD1Q5T7N2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
L1TD1Q5T7N2 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
L1TD1Q5T7N2 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
L1TD1Q5T7N2 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
L1TD1Q5T7N2 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
L1TD1Q5T7N2 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
L1TD1Q5T7N2 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
L1TD1Q5T7N2 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
L1TD1Q5T7N2 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
L1TD1Q5T7N2 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
L1TD1Q5T7N2 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
L1TD1Q5T7N2 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
L1TD1Q5T7N2 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
L1TD1Q5T7N2 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
L1TD1Q5T7N2 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
L1TD1Q5T7N2 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
L1TD1Q5T7N2 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
L1TD1Q5T7N2 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
L1TD1Q5T7N2 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
L1TD1Q5T7N2 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
L1TD1Q5T7N2 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
L1TD1Q5T7N2 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
L1TD1Q5T7N2 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
L1TD1Q5T7N2 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
L1TD1Q5T7N2 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
L1TD1Q5T7N2 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
L1TD1Q5T7N2 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
L1TD1Q5T7N2 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
L1TD1Q5T7N2 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
L1TD1Q5T7N2 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
L1TD1Q5T7N2 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
L1TD1Q5T7N2 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
L1TD1Q5T7N2 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
L1TD1Q5T7N2 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
L1TD1Q5T7N2 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
L1TD1Q5T7N2 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
L1TD1Q5T7N2 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
L1TD1Q5T7N2 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
L1TD1Q5T7N2 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
L1TD1Q5T7N2 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
L1TD1Q5T7N2 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
L1TD1Q5T7N2 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
L1TD1Q5T7N2 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
L1TD1Q5T7N2 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
L1TD1Q5T7N2 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
L1TD1Q5T7N2 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
L1TD1Q5T7N2 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
L1TD1Q5T7N2 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
L1TD1Q5T7N2 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
L1TD1Q5T7N2 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
L1TD1Q5T7N2 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
L1TD1Q5T7N2 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
L1TD1Q5T7N2 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
L1TD1Q5T7N2 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
L1TD1Q5T7N2 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
L1TD1Q5T7N2 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
L1TD1Q5T7N2 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
L1TD1Q5T7N2 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
L1TD1Q5T7N2 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
L1TD1Q5T7N2 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
L1TD1Q5T7N2 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms