Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0T0

MARCH8, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH8, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCH8Q5T0T0 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MARCH8Q5T0T0 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MARCH8Q5T0T0 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MARCH8Q5T0T0 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MARCH8Q5T0T0 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MARCH8Q5T0T0 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MARCH8Q5T0T0 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MARCH8Q5T0T0 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MARCH8Q5T0T0 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MARCH8Q5T0T0 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MARCH8Q5T0T0 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MARCH8Q5T0T0 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MARCH8Q5T0T0 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MARCH8Q5T0T0 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MARCH8Q5T0T0 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MARCH8Q5T0T0 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MARCH8Q5T0T0 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MARCH8Q5T0T0 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MARCH8Q5T0T0 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MARCH8Q5T0T0 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MARCH8Q5T0T0 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MARCH8Q5T0T0 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MARCH8Q5T0T0 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
MARCH8Q5T0T0 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MARCH8Q5T0T0 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
MARCH8Q5T0T0 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
MARCH8Q5T0T0 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MARCH8Q5T0T0 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MARCH8Q5T0T0 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MARCH8Q5T0T0 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MARCH8Q5T0T0 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MARCH8Q5T0T0 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MARCH8Q5T0T0 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MARCH8Q5T0T0 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
MARCH8Q5T0T0 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MARCH8Q5T0T0 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MARCH8Q5T0T0 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MARCH8Q5T0T0 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MARCH8Q5T0T0 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MARCH8Q5T0T0 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
MARCH8Q5T0T0 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MARCH8Q5T0T0 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MARCH8Q5T0T0 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MARCH8Q5T0T0 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MARCH8Q5T0T0 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MARCH8Q5T0T0 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MARCH8Q5T0T0 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MARCH8Q5T0T0 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
MARCH8Q5T0T0 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
MARCH8Q5T0T0 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MARCH8Q5T0T0 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MARCH8Q5T0T0 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
MARCH8Q5T0T0 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MARCH8Q5T0T0 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MARCH8Q5T0T0 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MARCH8Q5T0T0 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MARCH8Q5T0T0 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MARCH8Q5T0T0 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MARCH8Q5T0T0 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MARCH8Q5T0T0 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MARCH8Q5T0T0 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MARCH8Q5T0T0 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MARCH8Q5T0T0 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MARCH8Q5T0T0 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MARCH8Q5T0T0 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MARCH8Q5T0T0 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MARCH8Q5T0T0 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
MARCH8Q5T0T0 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MARCH8Q5T0T0 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MARCH8Q5T0T0 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MARCH8Q5T0T0 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MARCH8Q5T0T0 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MARCH8Q5T0T0 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
MARCH8Q5T0T0 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MARCH8Q5T0T0 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MARCH8Q5T0T0 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
MARCH8Q5T0T0 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
MARCH8Q5T0T0 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
MARCH8Q5T0T0 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MARCH8Q5T0T0 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MARCH8Q5T0T0 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
MARCH8Q5T0T0 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MARCH8Q5T0T0 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MARCH8Q5T0T0 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MARCH8Q5T0T0 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MARCH8Q5T0T0 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MARCH8Q5T0T0 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MARCH8Q5T0T0 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MARCH8Q5T0T0 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MARCH8Q5T0T0 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MARCH8Q5T0T0 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MARCH8Q5T0T0 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MARCH8Q5T0T0 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MARCH8Q5T0T0 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MARCH8Q5T0T0 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MARCH8Q5T0T0 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
MARCH8Q5T0T0 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
MARCH8Q5T0T0 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MARCH8Q5T0T0 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MARCH8Q5T0T0 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms