Protein–RNA interactions for Protein: Q53HC0

CCDC92, Coiled-coil domain-containing protein 92, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC92Q53HC0 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC92Q53HC0 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC92Q53HC0 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC92Q53HC0 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC92Q53HC0 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC92Q53HC0 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC92Q53HC0 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC92Q53HC0 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC92Q53HC0 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC92Q53HC0 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC92Q53HC0 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC92Q53HC0 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC92Q53HC0 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC92Q53HC0 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC92Q53HC0 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC92Q53HC0 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC92Q53HC0 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC92Q53HC0 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC92Q53HC0 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC92Q53HC0 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC92Q53HC0 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC92Q53HC0 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC92Q53HC0 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC92Q53HC0 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC92Q53HC0 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC92Q53HC0 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC92Q53HC0 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC92Q53HC0 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC92Q53HC0 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC92Q53HC0 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC92Q53HC0 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC92Q53HC0 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC92Q53HC0 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC92Q53HC0 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC92Q53HC0 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC92Q53HC0 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC92Q53HC0 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC92Q53HC0 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC92Q53HC0 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC92Q53HC0 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC92Q53HC0 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC92Q53HC0 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC92Q53HC0 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC92Q53HC0 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC92Q53HC0 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC92Q53HC0 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC92Q53HC0 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC92Q53HC0 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC92Q53HC0 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC92Q53HC0 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC92Q53HC0 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC92Q53HC0 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC92Q53HC0 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC92Q53HC0 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC92Q53HC0 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC92Q53HC0 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC92Q53HC0 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC92Q53HC0 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC92Q53HC0 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC92Q53HC0 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC92Q53HC0 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC92Q53HC0 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC92Q53HC0 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC92Q53HC0 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC92Q53HC0 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC92Q53HC0 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC92Q53HC0 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC92Q53HC0 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC92Q53HC0 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC92Q53HC0 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC92Q53HC0 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC92Q53HC0 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC92Q53HC0 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC92Q53HC0 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC92Q53HC0 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC92Q53HC0 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC92Q53HC0 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC92Q53HC0 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC92Q53HC0 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC92Q53HC0 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC92Q53HC0 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC92Q53HC0 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC92Q53HC0 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC92Q53HC0 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC92Q53HC0 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC92Q53HC0 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC92Q53HC0 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC92Q53HC0 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC92Q53HC0 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC92Q53HC0 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC92Q53HC0 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC92Q53HC0 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC92Q53HC0 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC92Q53HC0 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC92Q53HC0 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC92Q53HC0 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC92Q53HC0 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC92Q53HC0 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC92Q53HC0 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC92Q53HC0 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms