Protein–RNA interactions for Protein: Q53GD3

SLC44A4, Choline transporter-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC44A4Q53GD3 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLC44A4Q53GD3 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLC44A4Q53GD3 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLC44A4Q53GD3 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC44A4Q53GD3 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC44A4Q53GD3 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC44A4Q53GD3 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC44A4Q53GD3 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC44A4Q53GD3 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC44A4Q53GD3 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC44A4Q53GD3 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC44A4Q53GD3 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC44A4Q53GD3 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC44A4Q53GD3 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC44A4Q53GD3 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC44A4Q53GD3 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC44A4Q53GD3 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC44A4Q53GD3 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC44A4Q53GD3 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC44A4Q53GD3 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC44A4Q53GD3 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC44A4Q53GD3 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC44A4Q53GD3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC44A4Q53GD3 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC44A4Q53GD3 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC44A4Q53GD3 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC44A4Q53GD3 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC44A4Q53GD3 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC44A4Q53GD3 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC44A4Q53GD3 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC44A4Q53GD3 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC44A4Q53GD3 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC44A4Q53GD3 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC44A4Q53GD3 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC44A4Q53GD3 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC44A4Q53GD3 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC44A4Q53GD3 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC44A4Q53GD3 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC44A4Q53GD3 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC44A4Q53GD3 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC44A4Q53GD3 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC44A4Q53GD3 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC44A4Q53GD3 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC44A4Q53GD3 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC44A4Q53GD3 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC44A4Q53GD3 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC44A4Q53GD3 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC44A4Q53GD3 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC44A4Q53GD3 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC44A4Q53GD3 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC44A4Q53GD3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC44A4Q53GD3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC44A4Q53GD3 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC44A4Q53GD3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC44A4Q53GD3 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC44A4Q53GD3 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC44A4Q53GD3 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC44A4Q53GD3 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC44A4Q53GD3 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC44A4Q53GD3 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC44A4Q53GD3 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC44A4Q53GD3 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC44A4Q53GD3 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC44A4Q53GD3 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC44A4Q53GD3 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC44A4Q53GD3 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC44A4Q53GD3 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC44A4Q53GD3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC44A4Q53GD3 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC44A4Q53GD3 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC44A4Q53GD3 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC44A4Q53GD3 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC44A4Q53GD3 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC44A4Q53GD3 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC44A4Q53GD3 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC44A4Q53GD3 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC44A4Q53GD3 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC44A4Q53GD3 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC44A4Q53GD3 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC44A4Q53GD3 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC44A4Q53GD3 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC44A4Q53GD3 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC44A4Q53GD3 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC44A4Q53GD3 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC44A4Q53GD3 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC44A4Q53GD3 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC44A4Q53GD3 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC44A4Q53GD3 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC44A4Q53GD3 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC44A4Q53GD3 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC44A4Q53GD3 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC44A4Q53GD3 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC44A4Q53GD3 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC44A4Q53GD3 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC44A4Q53GD3 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC44A4Q53GD3 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC44A4Q53GD3 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC44A4Q53GD3 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC44A4Q53GD3 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC44A4Q53GD3 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.2 ms