Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC38Q502W7 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC38Q502W7 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC38Q502W7 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC38Q502W7 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC38Q502W7 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC38Q502W7 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC38Q502W7 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC38Q502W7 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC38Q502W7 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC38Q502W7 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC38Q502W7 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC38Q502W7 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC38Q502W7 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC38Q502W7 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC38Q502W7 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC38Q502W7 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC38Q502W7 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC38Q502W7 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC38Q502W7 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC38Q502W7 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC38Q502W7 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC38Q502W7 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC38Q502W7 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC38Q502W7 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC38Q502W7 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC38Q502W7 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC38Q502W7 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC38Q502W7 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC38Q502W7 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC38Q502W7 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC38Q502W7 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC38Q502W7 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC38Q502W7 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC38Q502W7 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC38Q502W7 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC38Q502W7 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC38Q502W7 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC38Q502W7 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC38Q502W7 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC38Q502W7 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC38Q502W7 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC38Q502W7 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC38Q502W7 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC38Q502W7 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC38Q502W7 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC38Q502W7 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC38Q502W7 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC38Q502W7 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC38Q502W7 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC38Q502W7 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC38Q502W7 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC38Q502W7 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC38Q502W7 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC38Q502W7 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC38Q502W7 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC38Q502W7 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC38Q502W7 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC38Q502W7 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC38Q502W7 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC38Q502W7 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC38Q502W7 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC38Q502W7 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC38Q502W7 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC38Q502W7 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC38Q502W7 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC38Q502W7 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC38Q502W7 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC38Q502W7 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC38Q502W7 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC38Q502W7 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC38Q502W7 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC38Q502W7 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC38Q502W7 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC38Q502W7 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC38Q502W7 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC38Q502W7 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC38Q502W7 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC38Q502W7 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC38Q502W7 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC38Q502W7 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC38Q502W7 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC38Q502W7 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC38Q502W7 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC38Q502W7 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC38Q502W7 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC38Q502W7 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC38Q502W7 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC38Q502W7 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC38Q502W7 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC38Q502W7 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC38Q502W7 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC38Q502W7 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC38Q502W7 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC38Q502W7 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC38Q502W7 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC38Q502W7 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC38Q502W7 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC38Q502W7 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC38Q502W7 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms