Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TWISTNBQ3B726 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TWISTNBQ3B726 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TWISTNBQ3B726 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TWISTNBQ3B726 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TWISTNBQ3B726 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TWISTNBQ3B726 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TWISTNBQ3B726 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TWISTNBQ3B726 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TWISTNBQ3B726 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TWISTNBQ3B726 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TWISTNBQ3B726 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TWISTNBQ3B726 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TWISTNBQ3B726 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TWISTNBQ3B726 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TWISTNBQ3B726 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TWISTNBQ3B726 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TWISTNBQ3B726 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TWISTNBQ3B726 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TWISTNBQ3B726 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
TWISTNBQ3B726 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TWISTNBQ3B726 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TWISTNBQ3B726 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TWISTNBQ3B726 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
TWISTNBQ3B726 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TWISTNBQ3B726 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TWISTNBQ3B726 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TWISTNBQ3B726 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TWISTNBQ3B726 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TWISTNBQ3B726 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TWISTNBQ3B726 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TWISTNBQ3B726 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TWISTNBQ3B726 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TWISTNBQ3B726 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TWISTNBQ3B726 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
TWISTNBQ3B726 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
TWISTNBQ3B726 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
TWISTNBQ3B726 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
TWISTNBQ3B726 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC28.95■■■□□ 2.22
TWISTNBQ3B726 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
TWISTNBQ3B726 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TWISTNBQ3B726 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TWISTNBQ3B726 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
TWISTNBQ3B726 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TWISTNBQ3B726 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TWISTNBQ3B726 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TWISTNBQ3B726 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TWISTNBQ3B726 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TWISTNBQ3B726 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TWISTNBQ3B726 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TWISTNBQ3B726 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TWISTNBQ3B726 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TWISTNBQ3B726 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TWISTNBQ3B726 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TWISTNBQ3B726 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TWISTNBQ3B726 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
TWISTNBQ3B726 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TWISTNBQ3B726 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TWISTNBQ3B726 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TWISTNBQ3B726 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TWISTNBQ3B726 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TWISTNBQ3B726 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TWISTNBQ3B726 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TWISTNBQ3B726 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TWISTNBQ3B726 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TWISTNBQ3B726 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
TWISTNBQ3B726 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
TWISTNBQ3B726 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
TWISTNBQ3B726 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TWISTNBQ3B726 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TWISTNBQ3B726 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TWISTNBQ3B726 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
TWISTNBQ3B726 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TWISTNBQ3B726 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TWISTNBQ3B726 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TWISTNBQ3B726 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TWISTNBQ3B726 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TWISTNBQ3B726 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
TWISTNBQ3B726 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TWISTNBQ3B726 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TWISTNBQ3B726 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
TWISTNBQ3B726 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
TWISTNBQ3B726 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TWISTNBQ3B726 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TWISTNBQ3B726 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TWISTNBQ3B726 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TWISTNBQ3B726 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TWISTNBQ3B726 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TWISTNBQ3B726 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TWISTNBQ3B726 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
TWISTNBQ3B726 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TWISTNBQ3B726 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TWISTNBQ3B726 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TWISTNBQ3B726 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TWISTNBQ3B726 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TWISTNBQ3B726 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TWISTNBQ3B726 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TWISTNBQ3B726 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
TWISTNBQ3B726 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
TWISTNBQ3B726 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms